More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2801 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  83.61 
 
 		 425 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  77.43 
 
 		 416 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  77.43 
 
 		 416 aa  656    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  79.95 
 
 		 416 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  81.24 
 
 		 416 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  78.38 
 
 		 416 aa  661    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 423 aa  882    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  89.36 
 
 		 423 aa  769    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  81.95 
 
 		 416 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  80.76 
 
 		 416 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  78.72 
 
 		 417 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  81.71 
 
 		 416 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  78.62 
 
 		 416 aa  666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  78.38 
 
 		 416 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  77.91 
 
 		 416 aa  653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  64.85 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  65.08 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  65.71 
 
 		 415 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  65.71 
 
 		 415 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  62.38 
 
 		 415 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  67.22 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  67.22 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  67.22 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  67.22 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  67.22 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  66.98 
 
 		 416 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  67.22 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  67.22 
 
 		 416 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  67.22 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  63.59 
 
 		 416 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  62.95 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  64.22 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  63.98 
 
 		 426 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  63.51 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  62.47 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  63.27 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  62.56 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  62.56 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  61.85 
 
 		 425 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  62.32 
 
 		 425 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  61.85 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  61.94 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  60.1 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  61.05 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  61.05 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  53.9 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  52.96 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  50.12 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  61.75 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  50.36 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  49.76 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  66.44 
 
 		 290 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  54.15 
 
 		 284 aa  299  8e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.84 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.73 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.94 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1218  formyl-coenzyme A transferase  86.21 
 
 		 117 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.437775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  31.67 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.13 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.77 
 
 		 388 aa  206  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.64 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.95 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.37 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  31.69 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0899  Formyl-CoA transferase  31.03 
 
 		 427 aa  200  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.41 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.43 
 
 		 395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.38 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1080  Formyl-CoA transferase  33.25 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.982565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3426  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.05 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  33.18 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3774  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.36 
 
 		 811 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199117  normal  0.974632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.42 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3860  Formyl-CoA transferase  30.99 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.01 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3835  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.63 
 
 		 811 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3762  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.63 
 
 		 811 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1735  Formyl-CoA transferase  30.36 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1907  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.93 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.323218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.07 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5895  Formyl-CoA transferase  30.21 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.73 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.73 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0458  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.95 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5531  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.21 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0937  Formyl-CoA transferase  29.95 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.03 
 
 		 413 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6404  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.95 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1981  Formyl-CoA transferase  30.28 
 
 		 425 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  hitchhiker  0.00178281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.47 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6531  Formyl-CoA transferase  28.57 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.830415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0899  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.09 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  31.35 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6246  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.81 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04230  CAIB/BAIF family enzyme (AFU_orthologue; AFUA_1G06250)  30.56 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0128507  normal  0.310252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0159  CAIB/BAIF family protein  31.8 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000839359  hitchhiker  0.0000973372 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.82 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.440176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6256  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.67 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1386  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.07 
 
 		 406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331191  normal  0.197084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.91 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>