More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2501 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  81 
 
 		 423 aa  687    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  74.7 
 
 		 416 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  76.32 
 
 		 416 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  100 
 
 		 425 aa  888    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  83.61 
 
 		 423 aa  707    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  76.79 
 
 		 416 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  77.75 
 
 		 416 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  75.84 
 
 		 417 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  75.12 
 
 		 416 aa  631  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  74.16 
 
 		 416 aa  624  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  74.64 
 
 		 416 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  74.64 
 
 		 416 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  73.44 
 
 		 416 aa  614  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  72.49 
 
 		 416 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  72.49 
 
 		 416 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  64.27 
 
 		 415 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  64.27 
 
 		 415 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  64.51 
 
 		 415 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  64.51 
 
 		 415 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  67.46 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  67.46 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  67.46 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  67.46 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  67.46 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  67.46 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  67.46 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  67.46 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  67.22 
 
 		 416 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  60.91 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  62.86 
 
 		 416 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  62.29 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  61.58 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  61.39 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  62.29 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  61.34 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  61.81 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  61.34 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  61.34 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  61.81 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  60.62 
 
 		 429 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  60.62 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  60.19 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  60.62 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  59.9 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  60.86 
 
 		 425 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  52.24 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  51.56 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  50.96 
 
 		 452 aa  415  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  51.71 
 
 		 409 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  49.76 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  57.83 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  64.97 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.52 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.81 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.27 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  33.18 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.1 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.22 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1080  Formyl-CoA transferase  34.67 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.982565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3860  Formyl-CoA transferase  32.24 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.49 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1218  formyl-coenzyme A transferase  81.58 
 
 		 117 aa  205  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.437775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.09 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.89 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.19 
 
 		 423 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.43 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1386  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.09 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331191  normal  0.197084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.88 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1408  Formyl-CoA transferase  31.86 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0926  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.86 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.12 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1907  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.09 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.323218 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  32.56 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  32.56 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  32.56 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  32.56 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.7 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  33.26 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  32.25 
 
 		 544 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  32.25 
 
 		 577 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.12 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  32.25 
 
 		 568 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4552  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.63 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  32.37 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.54 
 
 		 407 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.21 
 
 		 415 aa  196  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.48 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.78 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  29.85 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  32.71 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.17 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.1 
 
 		 415 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  31.84 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1735  Formyl-CoA transferase  31.49 
 
 		 448 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  33.01 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0159  CAIB/BAIF family protein  32.47 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000839359  hitchhiker  0.0000973372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.43 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5950  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.39 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1981  Formyl-CoA transferase  31.41 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  hitchhiker  0.00178281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.56 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>