More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3762 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3835  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
811 aa  1632    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4229  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  73.73 
 
 
836 aa  1211    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2423  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  75.22 
 
 
805 aa  1205    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3774  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  98.77 
 
 
811 aa  1613    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199117  normal  0.974632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3762  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
811 aa  1632    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1581  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.13 
 
 
814 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3893  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.97 
 
 
820 aa  317  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.454533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1575  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.09 
 
 
814 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.889584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4970  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.05 
 
 
823 aa  303  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.883575  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3113  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.8 
 
 
399 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  36.63 
 
 
416 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  34.04 
 
 
415 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1080  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.57 
 
 
399 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3563  Formyl-CoA transferase  31.54 
 
 
399 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1829  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.73 
 
 
413 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0077  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.12 
 
 
398 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2125  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.21 
 
 
398 aa  213  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1234  Formyl-CoA transferase  36.61 
 
 
402 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704005  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4036  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.23 
 
 
433 aa  211  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615075  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  33.33 
 
 
416 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  34.89 
 
 
418 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16130  hypothetical protein  34.12 
 
 
409 aa  211  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.84 
 
 
413 aa  211  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4144  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.07 
 
 
399 aa  211  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.698652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2108  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.85 
 
 
398 aa  210  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1475  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.86 
 
 
399 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1651  Formyl-CoA transferase  35.83 
 
 
418 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.579204  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4246  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.86 
 
 
399 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3505  Formyl-CoA transferase  32.85 
 
 
411 aa  209  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2358  hypothetical protein  33.1 
 
 
413 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0628874  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  33.81 
 
 
404 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  33.65 
 
 
429 aa  207  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0954  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.79 
 
 
421 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0829746  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2730  acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase  34.78 
 
 
405 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743365  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  33.65 
 
 
429 aa  207  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2359  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.99 
 
 
406 aa  207  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.433272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3495  Formyl-CoA transferase  34.07 
 
 
402 aa  207  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36601  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  32.15 
 
 
415 aa  206  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1691  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.19 
 
 
396 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2222  CAIB/BAIF family protein  33.49 
 
 
401 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1473  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.85 
 
 
411 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2872  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.99 
 
 
406 aa  206  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1212  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.19 
 
 
396 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.92 
 
 
426 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3093  Formyl-CoA transferase  33.82 
 
 
402 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0159656  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.15 
 
 
418 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1386  hypothetical protein  34.56 
 
 
399 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0255273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1197  hypothetical protein  34.98 
 
 
405 aa  205  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71679  normal  0.667677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  33.18 
 
 
429 aa  205  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3268  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.69 
 
 
391 aa  205  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304167  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.77 
 
 
411 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.8 
 
 
418 aa  203  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.19 
 
 
413 aa  203  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1555  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.43 
 
 
396 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.03 
 
 
418 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3276  hypothetical protein  37.65 
 
 
400 aa  203  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000379613  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2240  CAIB/BAIF family protein  33.75 
 
 
401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0049  CAIB/BAIF family protein  33.75 
 
 
401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1358  CAIB/BAIF family protein  33.75 
 
 
401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0294  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.15 
 
 
406 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.316386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2370  CAIB/BAIF family protein  33.75 
 
 
401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.907744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1033  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.09 
 
 
399 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1120  CAIB/BAIF family protein  33.75 
 
 
401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2202  CAIB/BAIF family protein  33.75 
 
 
401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1848  CAIB/BAIF family protein  33.75 
 
 
401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00504727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1449  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.77 
 
 
401 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  32.55 
 
 
416 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.43 
 
 
396 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1599  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.61 
 
 
396 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1663  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.68 
 
 
396 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1979  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.6 
 
 
394 aa  201  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  33.5 
 
 
404 aa  201  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4852  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.43 
 
 
396 aa  201  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.39 
 
 
423 aa  200  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1444  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.78 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141686  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1735  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 
401 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0615326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  32.37 
 
 
415 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1380  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.78 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.260314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1329  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.86 
 
 
423 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.94269  normal  0.646992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  31.89 
 
 
415 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  32.24 
 
 
425 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  32.47 
 
 
425 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1762  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 
401 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  31.76 
 
 
425 aa  198  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1851  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.66 
 
 
404 aa  198  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.990249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  31.82 
 
 
425 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11894  hypothetical protein  28.3 
 
 
802 aa  197  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.291529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1831  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.5 
 
 
414 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00867179  normal  0.544825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2206  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.89 
 
 
406 aa  197  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  31.53 
 
 
425 aa  197  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  31.58 
 
 
425 aa  197  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6435  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.41 
 
 
415 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2745  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.85 
 
 
418 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.9 
 
 
423 aa  196  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1522  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.2 
 
 
409 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0346  Formyl-CoA transferase  33.01 
 
 
412 aa  196  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.17 
 
 
401 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0990  putative carnitine dehydratase  33.66 
 
 
396 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  32.57 
 
 
395 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6255  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.17 
 
 
401 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>