More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4663 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  74.7 
 
 		 425 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  83.17 
 
 		 416 aa  706    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 416 aa  861    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  87.74 
 
 		 416 aa  755    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  88.7 
 
 		 416 aa  757    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  83.17 
 
 		 416 aa  703    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  83.17 
 
 		 416 aa  703    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  79.95 
 
 		 423 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  87.98 
 
 		 416 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  82.34 
 
 		 423 aa  695    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  81.97 
 
 		 416 aa  700    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  84.58 
 
 		 417 aa  714    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  83.89 
 
 		 416 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  84.62 
 
 		 416 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  83.17 
 
 		 416 aa  705    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  68.51 
 
 		 415 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  68.27 
 
 		 415 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  70.19 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  67.31 
 
 		 415 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  67.31 
 
 		 415 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  65.62 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  69.95 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  70.19 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  68.2 
 
 		 416 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  65.62 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  65.3 
 
 		 425 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  65.54 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  64.18 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  64.59 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  65.06 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  64.59 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  64.58 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  64.59 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  63.88 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  64.1 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  63.37 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  64.72 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  64.72 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  64.72 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  54.3 
 
 		 410 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  53.88 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  54.72 
 
 		 409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  71.38 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  51.32 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  62.96 
 
 		 334 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  50.84 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.35 
 
 		 284 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.92 
 
 		 410 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.85 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.76 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  33.74 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.85 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.35 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  33.1 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.49 
 
 		 407 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.82 
 
 		 423 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1218  formyl-coenzyme A transferase  82.05 
 
 		 117 aa  209  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.437775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4517  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.18 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.85 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.06 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.05 
 
 		 413 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1080  Formyl-CoA transferase  34.2 
 
 		 419 aa  205  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.982565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1581  Formyl-CoA transferase  34.57 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102552  hitchhiker  0.00374434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.05 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3860  Formyl-CoA transferase  32.14 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  30.55 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3426  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.94 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  30.86 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5950  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.83 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.33 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  30.62 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  31.12 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2692  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.02 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.514064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03190  expressed protein  32.48 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7291  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.25 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6977  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.21 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  32.06 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0281  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.87 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  31.62 
 
 		 435 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3001  CAIB/BAIF family protein  30.02 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0834933  normal  0.0227508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0223  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.56 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  30.5 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2771  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.83 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  33.18 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.32 
 
 		 406 aa  196  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.92 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.12 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0159  CAIB/BAIF family protein  31.92 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000839359  hitchhiker  0.0000973372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1429  CAIB/BAIF family protein  32.17 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.587908  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6300  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.67 
 
 		 399 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1234  Formyl-CoA transferase  33.01 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2644  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.71 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5916  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.5 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>