More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6300 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6300  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
399 aa  819    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3563  Formyl-CoA transferase  42.03 
 
 
399 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0077  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.08 
 
 
398 aa  332  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1331  Formyl-CoA transferase  44.58 
 
 
452 aa  328  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3495  Formyl-CoA transferase  42.31 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36601  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  42.53 
 
 
398 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3093  Formyl-CoA transferase  41.54 
 
 
402 aa  323  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0159656  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0856  Formyl-CoA transferase  43.4 
 
 
399 aa  322  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4904  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.8 
 
 
397 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16130  hypothetical protein  41.88 
 
 
409 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  41.01 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2550  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.7 
 
 
408 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1555  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.64 
 
 
396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4144  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.62 
 
 
399 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.698652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2108  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.01 
 
 
398 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.13 
 
 
396 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  41.1 
 
 
404 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4175  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.91 
 
 
406 aa  316  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1599  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.71 
 
 
396 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1386  hypothetical protein  40.91 
 
 
399 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0255273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1473  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.91 
 
 
411 aa  315  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4852  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.62 
 
 
396 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1330  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.89 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2730  acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase  42.36 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743365  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1691  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.37 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1212  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.37 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1080  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.36 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1133  Formyl-CoA transferase  41.98 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3975  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.46 
 
 
408 aa  312  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.36423  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0910  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.26 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.397198  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3113  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.12 
 
 
399 aa  312  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1444  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.75 
 
 
401 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141686  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3871  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.68 
 
 
397 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.39623  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1380  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.75 
 
 
401 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.260314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0909  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.19 
 
 
479 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6913  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.04 
 
 
396 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269365  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1041  Formyl-CoA transferase  41.73 
 
 
402 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1663  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.12 
 
 
396 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1813  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.95 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.542825  normal  0.0368115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1197  hypothetical protein  41.48 
 
 
405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71679  normal  0.667677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4176  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.75 
 
 
426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.949796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3505  Formyl-CoA transferase  40.51 
 
 
411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0346  Formyl-CoA transferase  40.89 
 
 
412 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1651  Formyl-CoA transferase  40.85 
 
 
418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.579204  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4036  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.31 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615075  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5093  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.93 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0990  putative carnitine dehydratase  40.51 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1033  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.1 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2125  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.93 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2722  hypothetical protein  40.69 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1234  Formyl-CoA transferase  41.35 
 
 
402 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1475  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.52 
 
 
399 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3391  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.85 
 
 
399 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.592416  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4246  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.52 
 
 
399 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0294  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.48 
 
 
406 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.316386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0174  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  39.05 
 
 
400 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3718  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.14 
 
 
402 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3894  CAIB/BAIF family protein  39.34 
 
 
396 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0523257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3268  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.16 
 
 
391 aa  296  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2222  CAIB/BAIF family protein  41.37 
 
 
401 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1590  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.34 
 
 
396 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296049  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3276  hypothetical protein  42.27 
 
 
400 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000379613  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1449  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.6 
 
 
401 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4249  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.15 
 
 
397 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2874  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.4 
 
 
405 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423527  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6214  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.04 
 
 
418 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1829  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.06 
 
 
413 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2872  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.41 
 
 
406 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0872  Formyl-CoA transferase  39.69 
 
 
397 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148474  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2358  hypothetical protein  40.81 
 
 
413 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0628874  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1735  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.6 
 
 
401 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0615326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1762  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.35 
 
 
401 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2359  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.41 
 
 
406 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.433272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0954  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.07 
 
 
421 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0829746  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1100  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.48 
 
 
419 aa  289  8e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0953  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.9 
 
 
384 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.1 
 
 
401 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1314  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.1 
 
 
397 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6255  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.1 
 
 
401 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1848  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.1 
 
 
401 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2745  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.34 
 
 
418 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2499  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.69 
 
 
415 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2861  Formyl-CoA transferase  38.79 
 
 
410 aa  286  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.744926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5125  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.85 
 
 
401 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126904  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2240  CAIB/BAIF family protein  40.68 
 
 
401 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2202  CAIB/BAIF family protein  40.68 
 
 
401 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1358  CAIB/BAIF family protein  40.68 
 
 
401 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0049  CAIB/BAIF family protein  40.68 
 
 
401 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1848  CAIB/BAIF family protein  40.68 
 
 
401 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00504727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1120  CAIB/BAIF family protein  40.68 
 
 
401 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2370  CAIB/BAIF family protein  40.68 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.907744  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3879  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375173  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6977  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.49 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5025  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.93 
 
 
396 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.422666  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0143  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.9 
 
 
413 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6186  Formyl-CoA transferase  40.2 
 
 
386 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101384  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4465  Formyl-CoA transferase  38.85 
 
 
400 aa  276  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3446  Formyl-CoA transferase  38.71 
 
 
415 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1895  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.6 
 
 
400 aa  272  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.07 
 
 
419 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>