More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4121 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  100 
 
 		 409 aa  834    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  66.67 
 
 		 410 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  66.41 
 
 		 410 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  61.46 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  61.54 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  61.06 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  60.82 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  60.58 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  60.58 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  58.65 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  60.34 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  59.52 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  60.39 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  59.38 
 
 		 425 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  59.62 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  58.41 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  59.04 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  59.04 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  58.17 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  59.38 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  59.32 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  59.13 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  58.94 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  59.13 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  58.17 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  54.74 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  54.99 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  54.99 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  54.5 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  54.74 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  54.44 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  54.01 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  54.26 
 
 		 416 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  53.01 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  53.72 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  53.77 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  54.2 
 
 		 416 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  54.2 
 
 		 416 aa  411  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  54.2 
 
 		 416 aa  411  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  54.2 
 
 		 416 aa  411  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  54.2 
 
 		 416 aa  411  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  54.2 
 
 		 416 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  54.2 
 
 		 416 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  52.94 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  53.96 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  54.2 
 
 		 416 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  51.18 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  50.12 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  51.71 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  55.38 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  44.15 
 
 		 452 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.41 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.59 
 
 		 410 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.82 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4517  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.81 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.71 
 
 		 407 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.78 
 
 		 423 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.59 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  36.17 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7291  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.71 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.05 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  36.17 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0281  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.88 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.35 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.94 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.05 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.56 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.21 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1581  Formyl-CoA transferase  36.94 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102552  hitchhiker  0.00374434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24920  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.62 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534139  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  34.39 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.94 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2644  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.85 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.97 
 
 		 413 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6415  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.1 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.835321 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.19 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3563  Formyl-CoA transferase  33.01 
 
 		 399 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0159  CAIB/BAIF family protein  34.76 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000839359  hitchhiker  0.0000973372 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.63 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0440  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.21 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  36.41 
 
 		 544 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.09 
 
 		 415 aa  212  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5067  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.52 
 
 		 406 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000803065  hitchhiker  0.00823437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0178  Formyl-CoA transferase  34.29 
 
 		 406 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000710796  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  36.41 
 
 		 568 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  36.41 
 
 		 577 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  36.41 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  36.41 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  36.41 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  36.41 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3333  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.64 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0174  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  34.96 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0176  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.29 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247826  normal  0.235552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.27 
 
 		 426 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0223  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.66 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2979  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.68 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.475368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  36.26 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  33.41 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  32.39 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0899  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.62 
 
 		 407 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>