More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0487 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  81.41 
 
 		 425 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  80.71 
 
 		 425 aa  717    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  78.07 
 
 		 429 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  78.3 
 
 		 429 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  77.18 
 
 		 425 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  77.18 
 
 		 425 aa  694    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  82.35 
 
 		 425 aa  734    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  77.65 
 
 		 425 aa  702    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  77.12 
 
 		 426 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  75 
 
 		 415 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  76.5 
 
 		 415 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  77.22 
 
 		 415 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  78.35 
 
 		 425 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  74.58 
 
 		 415 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  78.12 
 
 		 425 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 		 425 aa  875    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  78.07 
 
 		 429 aa  690    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  76.5 
 
 		 415 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  76.5 
 
 		 415 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  74.46 
 
 		 416 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  70.74 
 
 		 412 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  77.84 
 
 		 334 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  66.03 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  65.79 
 
 		 416 aa  544  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  65.07 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  65.55 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  65.78 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  65.53 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  65.31 
 
 		 416 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  66.51 
 
 		 416 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  65.31 
 
 		 416 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  65.55 
 
 		 416 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  65.55 
 
 		 416 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  63.4 
 
 		 416 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  62.32 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  63.03 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  62.8 
 
 		 410 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  62.32 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  62.2 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  62.2 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  62.2 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  62.2 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  62.2 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  62.2 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  61.96 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  62.2 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  62.2 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  59.9 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  59.13 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  58.51 
 
 		 409 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  68.73 
 
 		 290 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  47.41 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.22 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  34.86 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.75 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.05 
 
 		 415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.97 
 
 		 407 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.42 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.06 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4517  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.75 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.64 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.54 
 
 		 419 aa  222  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0159  CAIB/BAIF family protein  33.33 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000839359  hitchhiker  0.0000973372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0176  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247826  normal  0.235552 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.62 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3495  Formyl-CoA transferase  33.66 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1581  Formyl-CoA transferase  36.88 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102552  hitchhiker  0.00374434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.49 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3093  Formyl-CoA transferase  32.85 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0159656  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0178  Formyl-CoA transferase  32.63 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000710796  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  34.62 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7291  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.56 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6904  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.87 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.18 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.7 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.17 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.49 
 
 		 426 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0034  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.65 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.74 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.31 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.95 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  34.05 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0899  Formyl-CoA transferase  32.95 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0321  CaiB/BaiF family protein  34.86 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0117662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0458  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.46 
 
 		 429 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0937  Formyl-CoA transferase  32.46 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.73 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  33.73 
 
 		 544 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  33.73 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  33.73 
 
 		 577 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  33.73 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  33.73 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  33.73 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  33.73 
 
 		 568 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  31.42 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  32.16 
 
 		 408 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0118  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.63 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000440239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  34.05 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  33.09 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.85 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>