More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0489 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  85.3 
 
 		 416 aa  726    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  85.78 
 
 		 416 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  82.65 
 
 		 416 aa  703    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  84.82 
 
 		 416 aa  714    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  87.71 
 
 		 416 aa  733    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 417 aa  864    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  84.58 
 
 		 416 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  84.58 
 
 		 416 aa  723    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  84.34 
 
 		 416 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  78.01 
 
 		 423 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  85.06 
 
 		 416 aa  722    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  78.72 
 
 		 423 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  85.54 
 
 		 416 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  84.34 
 
 		 416 aa  716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  75.84 
 
 		 425 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  69.02 
 
 		 415 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  68.78 
 
 		 415 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  68.95 
 
 		 415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  68.95 
 
 		 415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  71.08 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  71.08 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  67.63 
 
 		 416 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  71.08 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  71.08 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  71.08 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  71.08 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  71.08 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  65.22 
 
 		 415 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  70.84 
 
 		 416 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  71.08 
 
 		 416 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  66.99 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  67.55 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  66.34 
 
 		 426 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  64.58 
 
 		 412 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  66.1 
 
 		 425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  65.13 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  65.53 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  65.38 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  64.95 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  65.44 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  64.89 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  64.22 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  63.88 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  62.93 
 
 		 429 aa  534  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  62.93 
 
 		 429 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  55.23 
 
 		 410 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  54.74 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  53.66 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  53.01 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  64.4 
 
 		 334 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  71.72 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  51.09 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  58.09 
 
 		 284 aa  308  8e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.56 
 
 		 410 aa  233  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.9 
 
 		 416 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.5 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  34.3 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.75 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.73 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.5 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4517  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.3 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.38 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.86 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.05 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  31.75 
 
 		 404 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1218  formyl-coenzyme A transferase  84.48 
 
 		 117 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.437775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.76 
 
 		 406 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1234  Formyl-CoA transferase  34.89 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  32.13 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1080  Formyl-CoA transferase  35.01 
 
 		 419 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.982565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3495  Formyl-CoA transferase  31.5 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  30.64 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  32.13 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0937  Formyl-CoA transferase  32.21 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  31.68 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  32.46 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7291  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.89 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.95 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0458  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.21 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.25 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.85 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.01 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.86 
 
 		 415 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2222  CAIB/BAIF family protein  31.18 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3093  Formyl-CoA transferase  30.46 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0159656  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1581  Formyl-CoA transferase  33.64 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102552  hitchhiker  0.00374434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  34.06 
 
 		 396 aa  201  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6300  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.89 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.79 
 
 		 433 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0899  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.97 
 
 		 407 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2644  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.65 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  30.94 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3426  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.28 
 
 		 403 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5511  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.55 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91473  normal  0.324907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.53 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0899  Formyl-CoA transferase  31.7 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2771  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.73 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.98 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5895  Formyl-CoA transferase  30.79 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5531  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.79 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>