More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1356 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1356  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0613141  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8089  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2462  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1615  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.760983  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0860  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2998  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4009  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.671239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2965  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0095  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.768666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.04 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  35.71 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  28.73 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5574  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal  0.0662694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2742  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.68 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0588637  normal  0.665335 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  31.84 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 317 aa  95.9  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2953  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3717  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.168673 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  29.18 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  29.55 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1282  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  29.55 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  29.55 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  28.83 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  32.27 
 
 		 331 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2888  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4594  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  37.24 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  31.65 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  27.34 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  34.86 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.76 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.76 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.76 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.76 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.76 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  32.03 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.76 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  29.39 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.97 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.76 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4542  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3730  DNA-binding transcriptional regulator CynR  36.36 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  29.17 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  31.66 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.96 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0835  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0953  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>