More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0281 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0281  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 344 aa  666    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01010  monosaccharide ABC transporter membrane protein  72.54 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0048  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  49.85 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000309961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1050  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.94 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6196  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.48 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5624  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.27 
 
 		 362 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00270598  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5989  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.27 
 
 		 362 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492271  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6480  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.96 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.0988317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4811  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.65 
 
 		 365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177862  hitchhiker  0.000601572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2249  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.77 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0318239  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3038  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5960  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.25 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  0.0568328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5515  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.38 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.369376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2345  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.45 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4098  Monosaccharide-transporting ATPase  46.27 
 
 		 357 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4210  Monosaccharide-transporting ATPase  46.27 
 
 		 357 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.927832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6220  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.78 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5927  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.62 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0316378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0422  Monosaccharide-transporting ATPase  47.78 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1852  Monosaccharide-transporting ATPase  48.24 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.662863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0769  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  40.89 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.539322  normal  0.0929356 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4708  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.81 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3780  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.81 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.948724  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04099  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.81 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3763  Monosaccharide-transporting ATPase  39.81 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4800  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.81 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5750  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.81 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04063  hypothetical protein  39.81 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0415  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  40.06 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4484  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.49 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1415  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.04 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0981  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  40.76 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1907  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  41.67 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.893189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4853  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.85 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1723  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  41.35 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0136536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0967  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.43 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2056  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.59 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5051  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  41.21 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0479  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  37.15 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0714563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0151  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  37.15 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.302956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4065  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  37.15 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.937045  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4911  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.82 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716765  normal  0.452459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2150  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.92 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0341131  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  40.28 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1989  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  41.47 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1985  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  41.47 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310833  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2076  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  41.14 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.915821  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2117  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.02 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  41.26 
 
 		 348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.93 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3532  monosaccharide-transporting ATPase  40.13 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851212 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  39.16 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.72 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  45.02 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  40.12 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  42.69 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  42.29 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.44 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  43.03 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  39.23 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  39.68 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  41.67 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.04 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  37.76 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.63 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 388 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.75 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.01 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1226  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.22 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  40.21 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.8 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2130  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.67 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  40.25 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  39.86 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  42.46 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  39.86 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.94 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  41.26 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>