More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0422 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0422  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
329 aa  620  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3038  inner-membrane translocator  59.13 
 
 
349 aa  319  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6220  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  58.1 
 
 
327 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1852  Monosaccharide-transporting ATPase  59.94 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.662863  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4811  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  54.84 
 
 
365 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177862  hitchhiker  0.000601572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5515  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  53.38 
 
 
365 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.369376 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6196  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  54.84 
 
 
362 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5624  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  54.52 
 
 
362 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00270598  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5989  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  54.52 
 
 
362 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492271  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6480  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  54.52 
 
 
362 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.0988317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2249  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  51.24 
 
 
338 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0318239  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4098  Monosaccharide-transporting ATPase  53.85 
 
 
357 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4210  Monosaccharide-transporting ATPase  53.85 
 
 
357 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.927832  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1050  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  50.96 
 
 
342 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2345  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  54.84 
 
 
359 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5960  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  53.87 
 
 
362 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  0.0568328 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5927  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  54.52 
 
 
362 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0316378  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0769  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  48.24 
 
 
320 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.539322  normal  0.0929356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1907  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.79 
 
 
322 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.893189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1723  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.15 
 
 
322 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0136536  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4708  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.63 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5750  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.63 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04099  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  44.63 
 
 
331 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3763  Monosaccharide-transporting ATPase  44.63 
 
 
331 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04063  hypothetical protein  44.63 
 
 
331 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4800  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.63 
 
 
331 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3780  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.63 
 
 
331 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.948724  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4484  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.63 
 
 
331 aa  258  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4065  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.31 
 
 
330 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.937045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0479  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.31 
 
 
330 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0714563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0151  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.31 
 
 
330 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.302956  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2056  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.08 
 
 
320 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4911  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.28 
 
 
322 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716765  normal  0.452459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2150  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.82 
 
 
320 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0341131  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0415  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  43.97 
 
 
333 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4853  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  43.97 
 
 
330 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5051  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  46.13 
 
 
326 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0967  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.95 
 
 
330 aa  248  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0981  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.95 
 
 
329 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1415  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1989  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.65 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1985  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.65 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310833  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2076  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.915821  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01010  monosaccharide ABC transporter membrane protein  48.18 
 
 
346 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4765  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47 
 
 
330 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0281  Monosaccharide-transporting ATPase  47.78 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2130  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.7 
 
 
331 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2117  monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 
326 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4226  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  45.11 
 
 
320 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4036  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.98 
 
 
320 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0048  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  42.34 
 
 
340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000309961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3532  monosaccharide-transporting ATPase  44.52 
 
 
322 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0851212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1226  inner-membrane translocator  42 
 
 
341 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  40.33 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
334 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.87 
 
 
334 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.69 
 
 
312 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 
334 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 
334 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.28 
 
 
331 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
310 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.93 
 
 
358 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  39.87 
 
 
310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.32 
 
 
336 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.54 
 
 
333 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.23 
 
 
310 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
835 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.32 
 
 
323 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 
334 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  32.5 
 
 
354 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
326 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 
350 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 
335 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
311 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.11 
 
 
330 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 
330 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.11 
 
 
330 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
335 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.8 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  37.92 
 
 
346 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  37.09 
 
 
336 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33 
 
 
334 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
331 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.73 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.73 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.73 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.5 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.73 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
346 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.44 
 
 
342 aa  146  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
337 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  37.85 
 
 
328 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  39.62 
 
 
348 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  34.87 
 
 
353 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 
353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.81 
 
 
324 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  37.69 
 
 
325 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  39.07 
 
 
325 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>