More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01010  monosaccharide ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 346 aa  661    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0281  Monosaccharide-transporting ATPase  72.54 
 
 		 344 aa  464  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0048  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  52.57 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000309961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3038  inner-membrane translocator  44.94 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6196  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.24 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0422  Monosaccharide-transporting ATPase  48.18 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6480  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.06 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.0988317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5624  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.06 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00270598  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5989  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.06 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492271  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5515  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.72 
 
 		 365 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.369376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2345  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.51 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5960  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.99 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  0.0568328 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5927  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  43.61 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0316378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1050  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  41.79 
 
 		 342 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4811  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  40.57 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177862  hitchhiker  0.000601572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2249  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.32 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0318239  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4210  Monosaccharide-transporting ATPase  45.27 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.927832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4098  Monosaccharide-transporting ATPase  45.27 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1852  Monosaccharide-transporting ATPase  46.01 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.662863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6220  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  44.24 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0769  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.05 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.539322  normal  0.0929356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2056  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  40.06 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2076  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.76 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.915821  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1989  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.42 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1985  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  42.42 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310833  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1415  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  41.29 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2150  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.81 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0341131  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1907  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  40.25 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.893189 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4911  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.75 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716765  normal  0.452459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3532  monosaccharide-transporting ATPase  40.74 
 
 		 322 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1723  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  39.24 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0136536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0415  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.7 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4708  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.75 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  45.78 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  35.6 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5750  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.44 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4484  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.08 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04099  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.44 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3763  Monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04063  hypothetical protein  38.44 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4800  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.44 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3780  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.44 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.948724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4853  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.39 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0981  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  38.17 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.27 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0967  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  37.85 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  36.02 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.13 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.76 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.76 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0151  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  36.66 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.302956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.86 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0479  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  36.66 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0714563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4065  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  36.66 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.937045  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5051  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  37.18 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2117  monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1226  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.57 
 
 		 312 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  39.07 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.93 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  39.56 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  39.8 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  38.17 
 
 		 322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 388 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  38.69 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  39.56 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.13 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 		 356 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.19 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.79 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.19 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4226  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  40.54 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.27 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  40.47 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>