More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5515 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5515  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  100 
 
 
365 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.369376 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6480  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  88.96 
 
 
362 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.0988317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5624  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  88.96 
 
 
362 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00270598  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6196  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  84.51 
 
 
362 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5989  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  88.96 
 
 
362 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492271  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5960  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  89.05 
 
 
362 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  0.0568328 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5927  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  83.94 
 
 
362 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0316378  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2345  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  87.16 
 
 
359 aa  524  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4811  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  78.1 
 
 
365 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177862  hitchhiker  0.000601572 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4098  Monosaccharide-transporting ATPase  62.61 
 
 
357 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4210  Monosaccharide-transporting ATPase  62.61 
 
 
357 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.927832  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1050  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  63.09 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2249  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  61.8 
 
 
338 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0318239  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6220  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  59.26 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0769  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  53.89 
 
 
320 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.539322  normal  0.0929356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2150  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  52.94 
 
 
320 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0341131  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2056  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  51.41 
 
 
320 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1852  Monosaccharide-transporting ATPase  58.52 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.662863  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0151  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  51.4 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.302956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0479  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  51.4 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0714563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4065  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  51.4 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.937045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1989  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  52.54 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1985  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  52.54 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310833  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1415  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  53.23 
 
 
338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2076  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  52.54 
 
 
320 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.915821  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1723  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  50.62 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0136536  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0422  Monosaccharide-transporting ATPase  53.38 
 
 
329 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1907  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  50.31 
 
 
322 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.893189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4484  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.34 
 
 
331 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3763  Monosaccharide-transporting ATPase  47.34 
 
 
331 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4708  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.34 
 
 
331 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5750  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.34 
 
 
331 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04099  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  47.34 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04063  hypothetical protein  47.34 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4800  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.34 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3780  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.34 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.948724  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0967  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.32 
 
 
330 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4853  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  46.86 
 
 
330 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5051  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  50.16 
 
 
326 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0981  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.32 
 
 
329 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0415  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  47.17 
 
 
333 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4911  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  49.22 
 
 
322 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716765  normal  0.452459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3532  monosaccharide-transporting ATPase  51.54 
 
 
322 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0851212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4765  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  51.08 
 
 
330 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2130  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  51.57 
 
 
331 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4036  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  50 
 
 
320 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4226  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  50.16 
 
 
320 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3038  inner-membrane translocator  46.67 
 
 
349 aa  239  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2117  monosaccharide-transporting ATPase  48.14 
 
 
326 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1226  inner-membrane translocator  46.75 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0281  Monosaccharide-transporting ATPase  44.38 
 
 
344 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01010  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.72 
 
 
346 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0048  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  36.89 
 
 
340 aa  170  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000309961  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  41.39 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  34.97 
 
 
335 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  38.04 
 
 
348 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.83 
 
 
336 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.87 
 
 
331 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.61 
 
 
324 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.46 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 
345 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  34.37 
 
 
353 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
353 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.54 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  35.67 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  35.67 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.66 
 
 
330 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 
330 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.66 
 
 
330 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.93 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 
322 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  35.08 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.23 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.23 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 
334 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 
346 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  32.9 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  38.62 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  40.65 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  38.11 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  34.71 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  35.96 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  33.06 
 
 
381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 
332 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  32.97 
 
 
327 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>