More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1426 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1426  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 449 aa  901    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.745476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1127  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 447 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.923272  normal  0.0394514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4047  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0813  AMP-dependent synthetase and ligase  37.53 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3063  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214783  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3791  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 446 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.636512 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3895  hypothetical protein  33.95 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4593  AMP-dependent synthetase and ligase  26.91 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5054  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.606706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6525  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 		 495 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6726  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1373  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.67 
 
 		 575 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 		 526 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0995  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.07 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3072  hypothetical protein  27.08 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 662 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  23.01 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.45 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.67 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1028  putative AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 530 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0219794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1098  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  23.99 
 
 		 564 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  23.85 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  23.85 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  23.85 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 500 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  23.85 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  23.85 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  23.85 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.85 
 
 		 515 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  23.31 
 
 		 571 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  23.81 
 
 		 571 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5076  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.07 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 503 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4502  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.58 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404  normal  0.065196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  24.17 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  24.86 
 
 		 525 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 529 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  24.25 
 
 		 544 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  22.88 
 
 		 533 aa  100  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29237  predicted protein  25 
 
 		 356 aa  100  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3821  AMP-dependent synthetase and ligase  23.22 
 
 		 473 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3895  AMP-dependent synthetase and ligase  23.22 
 
 		 473 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  25.43 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0576  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0301  vibriobactin-specific 2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  25.35 
 
 		 543 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 		 508 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.57 
 
 		 564 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  23.78 
 
 		 572 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3807  AMP-dependent synthetase and ligase  22.76 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00941755  normal  0.205802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  23.78 
 
 		 572 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 516 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  24.02 
 
 		 555 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 516 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  22.19 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  24.33 
 
 		 541 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 502 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.75 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2354  putative acetyl-CoA synthetase  23.55 
 
 		 511 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.804997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 		 524 aa  97.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  24.93 
 
 		 544 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 520 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  22.55 
 
 		 502 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  24.85 
 
 		 509 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  23.89 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  22.57 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1674  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  23.82 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  25.49 
 
 		 519 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  23.26 
 
 		 541 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  25 
 
 		 535 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  26.11 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  24.72 
 
 		 496 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.41 
 
 		 519 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5773  AMP-dependent synthetase and ligase  24.41 
 
 		 563 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4256  AMP-dependent synthetase and ligase  21.71 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3663  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.75 
 
 		 565 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  22.22 
 
 		 564 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  22.77 
 
 		 525 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.66 
 
 		 519 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.35 
 
 		 538 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  23.72 
 
 		 523 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  22.19 
 
 		 510 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  23.72 
 
 		 523 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>