129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1891 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  100 
 
 		 768 aa  1533    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  47.8 
 
 		 716 aa  618  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1253  DNA polymerase I  31.99 
 
 		 679 aa  237  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  29.86 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  30.7 
 
 		 657 aa  229  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  29.02 
 
 		 655 aa  171  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  32.2 
 
 		 552 aa  140  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  33.45 
 
 		 562 aa  130  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  24.73 
 
 		 794 aa  125  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  25.27 
 
 		 783 aa  118  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  25.12 
 
 		 780 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  25.58 
 
 		 786 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  24.29 
 
 		 852 aa  108  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  24.9 
 
 		 783 aa  107  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  24.4 
 
 		 780 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  22.67 
 
 		 810 aa  105  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  26.39 
 
 		 871 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  26.48 
 
 		 853 aa  104  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  26.2 
 
 		 854 aa  103  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  24.55 
 
 		 785 aa  101  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  27 
 
 		 835 aa  101  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  25.95 
 
 		 781 aa  101  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  26.05 
 
 		 882 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  25.63 
 
 		 853 aa  100  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  24.82 
 
 		 781 aa  99.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  25.07 
 
 		 854 aa  99  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  26.32 
 
 		 877 aa  95.9  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  22.03 
 
 		 811 aa  95.5  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  26.8 
 
 		 784 aa  93.6  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  25.99 
 
 		 784 aa  85.9  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  29.52 
 
 		 941 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  23.02 
 
 		 821 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  24.86 
 
 		 792 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  23.45 
 
 		 787 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  24.65 
 
 		 1044 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  24.19 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  22.26 
 
 		 789 aa  70.9  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  21.31 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  23.42 
 
 		 793 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  29.14 
 
 		 932 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  22.36 
 
 		 810 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  23.53 
 
 		 795 aa  68.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  24.32 
 
 		 929 aa  68.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  22.09 
 
 		 810 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  23.12 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  23.36 
 
 		 808 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  25.71 
 
 		 1459 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  25.76 
 
 		 812 aa  67.4  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  24.69 
 
 		 607 aa  66.6  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2799  DNA polymerase B region  25.68 
 
 		 735 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  24.56 
 
 		 990 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.27 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  21.25 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  25.07 
 
 		 782 aa  65.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  25.56 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  22.67 
 
 		 810 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  23.65 
 
 		 1463 aa  65.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  22.19 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  21.65 
 
 		 1353 aa  64.7  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  21.09 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  22.19 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  23.62 
 
 		 912 aa  64.7  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  31.65 
 
 		 910 aa  64.3  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  25.19 
 
 		 789 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.68 
 
 		 787 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  21.96 
 
 		 982 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  25.19 
 
 		 789 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  25.19 
 
 		 789 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  23.35 
 
 		 818 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  23.73 
 
 		 1058 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  21.9 
 
 		 1485 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  23.77 
 
 		 788 aa  62  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  25.56 
 
 		 793 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  22.86 
 
 		 1070 aa  61.6  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  23.91 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.03 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  21.91 
 
 		 816 aa  60.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  23.68 
 
 		 787 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  23.45 
 
 		 796 aa  60.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  23.31 
 
 		 816 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  21.88 
 
 		 799 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  22.3 
 
 		 791 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  23.68 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  21.93 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  22.64 
 
 		 789 aa  58.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  24.44 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  22.18 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  23.83 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  22.68 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  21.77 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  22.93 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  22.59 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  20.32 
 
 		 794 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  24.06 
 
 		 794 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  24.06 
 
 		 794 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  24.63 
 
 		 786 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  24.19 
 
 		 788 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  25.63 
 
 		 795 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  22.43 
 
 		 820 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  23.44 
 
 		 786 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>