125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1253 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1253  DNA polymerase I  100 
 
 		 679 aa  1392    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  47.42 
 
 		 657 aa  620  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  42.68 
 
 		 655 aa  545  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  30.93 
 
 		 716 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  27.62 
 
 		 723 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  32.58 
 
 		 768 aa  231  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  30.92 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  32.91 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  22.76 
 
 		 783 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  23.27 
 
 		 785 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  23.18 
 
 		 784 aa  124  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  24.25 
 
 		 794 aa  124  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  23.12 
 
 		 786 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  30.04 
 
 		 783 aa  97.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  23.58 
 
 		 784 aa  95.9  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  26.27 
 
 		 607 aa  94.7  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  22.89 
 
 		 781 aa  92  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  24.8 
 
 		 853 aa  90.1  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  25.46 
 
 		 852 aa  84  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  23.6 
 
 		 835 aa  81.3  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  23.29 
 
 		 854 aa  80.5  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  20.99 
 
 		 781 aa  77.4  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  21.4 
 
 		 882 aa  76.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  23.99 
 
 		 877 aa  76.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  21.04 
 
 		 780 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  20.8 
 
 		 780 aa  73.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  22.59 
 
 		 853 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  20.28 
 
 		 810 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  25.86 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  23.08 
 
 		 854 aa  72.4  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  21.38 
 
 		 811 aa  72  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  26.73 
 
 		 782 aa  71.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  24.01 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  32.21 
 
 		 941 aa  70.5  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  23.72 
 
 		 871 aa  68.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  23.26 
 
 		 818 aa  68.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  27.69 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  23.89 
 
 		 796 aa  67  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  24.14 
 
 		 812 aa  67  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  25.68 
 
 		 1463 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.39 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  26.38 
 
 		 1459 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  23.73 
 
 		 912 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  27 
 
 		 795 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  21.53 
 
 		 1070 aa  63.9  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.53 
 
 		 795 aa  63.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  29.63 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  28.96 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  27.1 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  23.47 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  28.21 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  30.77 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  27.71 
 
 		 1485 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  28.08 
 
 		 932 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  29.27 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  25.77 
 
 		 816 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  30.19 
 
 		 789 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  30.46 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  26.95 
 
 		 787 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  24.31 
 
 		 793 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  24.61 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  30.46 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  24.23 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  25.52 
 
 		 982 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  25.47 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  25.52 
 
 		 808 aa  58.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  25.77 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  27.56 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  27.56 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  27.56 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  25 
 
 		 807 aa  57.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  23.89 
 
 		 810 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  28.93 
 
 		 787 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  23.9 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  28.93 
 
 		 788 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  27.04 
 
 		 788 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  26.06 
 
 		 816 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  25.38 
 
 		 791 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  27.04 
 
 		 788 aa  55.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  28.21 
 
 		 793 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  22.65 
 
 		 794 aa  54.7  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  24.63 
 
 		 801 aa  55.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  26.35 
 
 		 910 aa  54.3  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  25.2 
 
 		 809 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  23.64 
 
 		 792 aa  54.3  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  24.4 
 
 		 809 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  24.8 
 
 		 809 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  28.3 
 
 		 788 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  22.8 
 
 		 809 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  23.13 
 
 		 786 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  23.4 
 
 		 786 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  27.56 
 
 		 794 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  28.21 
 
 		 786 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  24.05 
 
 		 795 aa  52.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  23.23 
 
 		 799 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  28.29 
 
 		 794 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  28.29 
 
 		 794 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  26.38 
 
 		 786 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  26.11 
 
 		 786 aa  51.6  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  26.38 
 
 		 786 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>