136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3264 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  100 
 
 		 716 aa  1465    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  47.28 
 
 		 768 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1253  DNA polymerase I  30.59 
 
 		 679 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  30.28 
 
 		 723 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  29.83 
 
 		 657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  27.96 
 
 		 655 aa  190  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  30.77 
 
 		 552 aa  147  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  23.54 
 
 		 780 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  28.02 
 
 		 783 aa  140  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  23.31 
 
 		 780 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  22.71 
 
 		 810 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  29.48 
 
 		 562 aa  134  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  25.91 
 
 		 786 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  24.46 
 
 		 785 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  25.81 
 
 		 783 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  23.26 
 
 		 781 aa  127  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 794 aa  125  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  25.83 
 
 		 781 aa  123  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  20.22 
 
 		 811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  24.03 
 
 		 835 aa  114  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  27.2 
 
 		 784 aa  111  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  23.53 
 
 		 852 aa  108  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  23.35 
 
 		 854 aa  103  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  22.01 
 
 		 853 aa  99.8  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  26.22 
 
 		 782 aa  100  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  24.78 
 
 		 877 aa  99.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  27.11 
 
 		 1463 aa  94.7  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  21.06 
 
 		 854 aa  90.5  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  24.51 
 
 		 789 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  21.23 
 
 		 853 aa  90.1  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  23.13 
 
 		 784 aa  89.7  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  24.69 
 
 		 786 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  27.51 
 
 		 791 aa  89  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  23.03 
 
 		 882 aa  87.8  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  25.63 
 
 		 821 aa  87.8  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  23.93 
 
 		 793 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.94 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  24.63 
 
 		 799 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  26.36 
 
 		 793 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  27.07 
 
 		 794 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  24.84 
 
 		 794 aa  84  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  26.36 
 
 		 788 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  23.96 
 
 		 810 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  26.65 
 
 		 788 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  27.07 
 
 		 794 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  27.07 
 
 		 794 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.8 
 
 		 795 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  23.38 
 
 		 812 aa  82  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  24.78 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  25.98 
 
 		 787 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  22.68 
 
 		 810 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  22.68 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  24.11 
 
 		 912 aa  80.9  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  20.25 
 
 		 871 aa  80.9  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  21.33 
 
 		 818 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.79 
 
 		 787 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  26.07 
 
 		 792 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  23.54 
 
 		 1058 aa  78.6  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  23.4 
 
 		 797 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  23.66 
 
 		 1070 aa  77.8  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  25.5 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  26.14 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  23.74 
 
 		 982 aa  76.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  22.75 
 
 		 1353 aa  76.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  25 
 
 		 816 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  23.3 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  24.71 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  23.84 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  22 
 
 		 795 aa  75.1  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  26.2 
 
 		 786 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  24.57 
 
 		 1459 aa  74.7  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  26.12 
 
 		 786 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  22.94 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  26.73 
 
 		 787 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  21.5 
 
 		 764 aa  73.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  23.08 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  25.14 
 
 		 783 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  23.65 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  22.29 
 
 		 807 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  25.14 
 
 		 783 aa  72  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  24.86 
 
 		 820 aa  71.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  22.79 
 
 		 809 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  22.79 
 
 		 809 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.86 
 
 		 783 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  24.93 
 
 		 792 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  23.63 
 
 		 783 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  23.26 
 
 		 1044 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  23.79 
 
 		 801 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  24.86 
 
 		 783 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  24.54 
 
 		 789 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 783 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  24.54 
 
 		 789 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 783 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.58 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  24.36 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  23.58 
 
 		 783 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 783 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  24.54 
 
 		 789 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 783 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>