133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1060 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 764 aa  1524    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  39.82 
 
 		 783 aa  584  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  31.44 
 
 		 794 aa  422  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  31.12 
 
 		 786 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  30.93 
 
 		 783 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  30.28 
 
 		 781 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  31.57 
 
 		 785 aa  398  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  30.74 
 
 		 784 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  22.73 
 
 		 780 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  22.36 
 
 		 780 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  23.71 
 
 		 811 aa  168  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  22.38 
 
 		 781 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  22.99 
 
 		 810 aa  160  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  23.9 
 
 		 784 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  24.97 
 
 		 932 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  23.1 
 
 		 812 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  22.26 
 
 		 910 aa  124  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  21.34 
 
 		 982 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  22.77 
 
 		 941 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  21.64 
 
 		 607 aa  101  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  21.26 
 
 		 821 aa  95.5  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  24.11 
 
 		 1070 aa  94.4  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  20.98 
 
 		 796 aa  90.9  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  22.69 
 
 		 786 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  21.24 
 
 		 795 aa  87.8  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  23.96 
 
 		 789 aa  87.8  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  22.69 
 
 		 786 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  20.65 
 
 		 818 aa  87.4  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.86 
 
 		 787 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  22.06 
 
 		 787 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  21.86 
 
 		 788 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  22.12 
 
 		 816 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  23.04 
 
 		 792 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  22.41 
 
 		 786 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  21.57 
 
 		 788 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  20.28 
 
 		 912 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  22.85 
 
 		 791 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  22.17 
 
 		 785 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  21.72 
 
 		 789 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  20.3 
 
 		 882 aa  78.2  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  21.84 
 
 		 786 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  21.53 
 
 		 786 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  23.15 
 
 		 782 aa  74.7  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  20.14 
 
 		 854 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  20.05 
 
 		 877 aa  73.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  20.47 
 
 		 929 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  21.5 
 
 		 716 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  22.5 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  21.33 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  22.71 
 
 		 818 aa  72  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  22.21 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  21.75 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  21.75 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  21.75 
 
 		 783 aa  70.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  21.75 
 
 		 783 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  21.94 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  21.75 
 
 		 783 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  21.75 
 
 		 783 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  19.35 
 
 		 854 aa  70.5  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  19.62 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  19.54 
 
 		 853 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  21.53 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  22.24 
 
 		 788 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  21.32 
 
 		 794 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  21.61 
 
 		 1044 aa  69.3  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  22.64 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  24.52 
 
 		 783 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  24.52 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  21.23 
 
 		 835 aa  67.8  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  21.19 
 
 		 794 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  21.19 
 
 		 794 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  22.51 
 
 		 794 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  21.91 
 
 		 787 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  20.9 
 
 		 793 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  21.31 
 
 		 768 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  22.82 
 
 		 795 aa  66.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  21.75 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  21.14 
 
 		 791 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.03 
 
 		 783 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  23.1 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  24.03 
 
 		 783 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  23.5 
 
 		 820 aa  65.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  24.03 
 
 		 783 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  19.8 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  21.03 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.86 
 
 		 783 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  23.43 
 
 		 807 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  21.16 
 
 		 871 aa  62.4  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  22.43 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  19.06 
 
 		 1353 aa  62  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  21.88 
 
 		 799 aa  60.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  20.05 
 
 		 1485 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  20.79 
 
 		 789 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  20.83 
 
 		 1058 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  22.13 
 
 		 793 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  21.87 
 
 		 790 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  21.72 
 
 		 789 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  21.17 
 
 		 1345 aa  59.3  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  21.02 
 
 		 796 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  22.36 
 
 		 1463 aa  58.9  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>