131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0839 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  100 
 
 		 655 aa  1362    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1253  DNA polymerase I  42.68 
 
 		 679 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 657 aa  536  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  27.96 
 
 		 716 aa  190  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  27.67 
 
 		 723 aa  180  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  28.02 
 
 		 768 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  30.52 
 
 		 562 aa  146  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  31.78 
 
 		 552 aa  135  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  26.19 
 
 		 786 aa  98.2  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  23.67 
 
 		 854 aa  93.6  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  23.15 
 
 		 882 aa  92.8  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 783 aa  92  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  24.13 
 
 		 853 aa  91.7  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  22.99 
 
 		 853 aa  91.3  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  26.75 
 
 		 852 aa  91.3  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 785 aa  90.1  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  23.17 
 
 		 854 aa  90.1  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  26.96 
 
 		 784 aa  84.3  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  24.57 
 
 		 794 aa  84  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  23.09 
 
 		 781 aa  79.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  23.77 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  25.93 
 
 		 780 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  25.51 
 
 		 780 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  25 
 
 		 781 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  23.82 
 
 		 835 aa  74.7  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  23.08 
 
 		 783 aa  73.9  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  23.17 
 
 		 607 aa  72.8  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  22.79 
 
 		 811 aa  67.4  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  21.58 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  23.87 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  23.46 
 
 		 910 aa  62.4  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.07 
 
 		 784 aa  61.6  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  22.5 
 
 		 871 aa  61.6  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2799  DNA polymerase B region  23.32 
 
 		 735 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  24.14 
 
 		 821 aa  61.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  22.32 
 
 		 793 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  25 
 
 		 796 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  21.59 
 
 		 800 aa  60.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  22.55 
 
 		 789 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  24.45 
 
 		 807 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.53 
 
 		 787 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  23.94 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  23.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  23.2 
 
 		 932 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  23.35 
 
 		 794 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  23.26 
 
 		 796 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  22.89 
 
 		 788 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  22.18 
 
 		 792 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  24.22 
 
 		 821 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  23.08 
 
 		 912 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  21.4 
 
 		 810 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  21.32 
 
 		 808 aa  55.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  23.86 
 
 		 790 aa  55.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  21.41 
 
 		 795 aa  55.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  21.99 
 
 		 793 aa  55.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  26.32 
 
 		 1463 aa  55.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  23.08 
 
 		 788 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  26.28 
 
 		 793 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  25.83 
 
 		 788 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  25.83 
 
 		 788 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  24.62 
 
 		 792 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  26.28 
 
 		 794 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  22.31 
 
 		 787 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  26.28 
 
 		 794 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  23.23 
 
 		 783 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  21.89 
 
 		 816 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  26.28 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  26.28 
 
 		 794 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  22.98 
 
 		 795 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  26.09 
 
 		 788 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  21.03 
 
 		 810 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  24.81 
 
 		 941 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  22.43 
 
 		 782 aa  52.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  25 
 
 		 787 aa  52.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  24.2 
 
 		 816 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  21.16 
 
 		 1058 aa  51.2  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.62 
 
 		 786 aa  51.2  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  22.01 
 
 		 789 aa  51.2  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  20.22 
 
 		 1353 aa  50.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  23.6 
 
 		 818 aa  50.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  22.69 
 
 		 787 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  20.66 
 
 		 810 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  21.66 
 
 		 801 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  25 
 
 		 809 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  23.12 
 
 		 812 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  22.53 
 
 		 820 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  22.01 
 
 		 789 aa  50.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  25 
 
 		 786 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>