144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0144 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  49.1 
 
 
882 aa  783    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  55.92 
 
 
854 aa  981    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  50.18 
 
 
835 aa  813    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  57.35 
 
 
854 aa  993    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  56.16 
 
 
853 aa  981    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  56.55 
 
 
853 aa  986    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  45.29 
 
 
877 aa  727    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  100 
 
 
871 aa  1763    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  40.92 
 
 
852 aa  663    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  26.39 
 
 
785 aa  191  7e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  25.47 
 
 
794 aa  190  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  27.94 
 
 
781 aa  189  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  27.79 
 
 
780 aa  188  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  25.67 
 
 
784 aa  187  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  27.27 
 
 
786 aa  187  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  26.56 
 
 
780 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  26.92 
 
 
783 aa  178  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  26.16 
 
 
781 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  26.53 
 
 
810 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  23.97 
 
 
783 aa  147  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  25.16 
 
 
811 aa  139  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  27.71 
 
 
796 aa  134  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  26.55 
 
 
607 aa  132  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  25.23 
 
 
812 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.22 
 
 
784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  25.35 
 
 
782 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  25.19 
 
 
818 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  29.44 
 
 
1485 aa  117  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  28 
 
 
1463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  26.58 
 
 
912 aa  115  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  25.56 
 
 
929 aa  114  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.74 
 
 
790 aa  114  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  29.05 
 
 
1353 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  25.36 
 
 
791 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  24.48 
 
 
932 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  24.43 
 
 
816 aa  111  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  27.14 
 
 
821 aa  111  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.11 
 
 
818 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  24.69 
 
 
787 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  24.53 
 
 
786 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  25.43 
 
 
795 aa  109  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  28.33 
 
 
990 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  30.66 
 
 
1459 aa  108  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  25.67 
 
 
910 aa  107  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  24.37 
 
 
794 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  24.83 
 
 
787 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  25.51 
 
 
1070 aa  105  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  25.21 
 
 
786 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  24.88 
 
 
783 aa  104  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  24.88 
 
 
783 aa  104  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  24.65 
 
 
783 aa  104  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  24.73 
 
 
783 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  23.32 
 
 
792 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  24.73 
 
 
783 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  24.73 
 
 
783 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  25.31 
 
 
786 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  23.87 
 
 
743 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  25.15 
 
 
783 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  26.06 
 
 
788 aa  102  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  25.64 
 
 
793 aa  102  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  26.39 
 
 
768 aa  102  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  24.42 
 
 
783 aa  102  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  24.48 
 
 
1044 aa  101  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  24.34 
 
 
783 aa  101  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  24.61 
 
 
789 aa  101  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  25.12 
 
 
787 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  22.41 
 
 
941 aa  100  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  24.56 
 
 
786 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  25.37 
 
 
982 aa  99.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  25.04 
 
 
790 aa  98.2  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  25.5 
 
 
794 aa  98.2  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  25.07 
 
 
794 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  25.07 
 
 
794 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  24.2 
 
 
1087 aa  97.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  25.12 
 
 
786 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  23.17 
 
 
783 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  25 
 
 
786 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  22.86 
 
 
783 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  22.86 
 
 
783 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  25.93 
 
 
723 aa  95.9  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  23.02 
 
 
783 aa  95.5  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  24.58 
 
 
787 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  24.96 
 
 
821 aa  95.1  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  25.88 
 
 
787 aa  94.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  24.62 
 
 
789 aa  94.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  24.23 
 
 
657 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  24.33 
 
 
788 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  24.26 
 
 
820 aa  93.2  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  24.3 
 
 
788 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  25.21 
 
 
791 aa  93.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  24.44 
 
 
789 aa  92  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  24.44 
 
 
789 aa  91.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  24.44 
 
 
789 aa  92  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  24.47 
 
 
788 aa  91.3  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  24.4 
 
 
790 aa  89  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  25.72 
 
 
1058 aa  88.2  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  24.72 
 
 
788 aa  88.2  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  23.93 
 
 
793 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  23.25 
 
 
787 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  24.03 
 
 
807 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>