91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2586 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  100 
 
 		 320 aa  652    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  99.69 
 
 		 320 aa  650    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  95.03 
 
 		 321 aa  567  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  84.98 
 
 		 333 aa  533  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  84.33 
 
 		 317 aa  520  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  81.13 
 
 		 317 aa  517  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.56 
 
 		 321 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.19 
 
 		 319 aa  508  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  69.76 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  69.42 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  67.24 
 
 		 322 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  62.1 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  65.86 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  60.95 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  62.34 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  63.16 
 
 		 337 aa  391  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  60 
 
 		 334 aa  387  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  63.06 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.23 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  65.52 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  64.83 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  61.9 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.02 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  62.46 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.85 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  61.46 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  62.46 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  62.46 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  62.46 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  62.46 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  62.46 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  64.97 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  61.64 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.95 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  64.51 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  61.77 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  64.48 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  64.14 
 
 		 329 aa  371  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.67 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  58.02 
 
 		 312 aa  355  5e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.82 
 
 		 334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  63.1 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  50.17 
 
 		 313 aa  328  6e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  48.62 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  49.14 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  45.26 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  43.92 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  43.67 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  44.33 
 
 		 333 aa  256  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  44.37 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  41.45 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.58 
 
 		 301 aa  252  7e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  45.37 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.05 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.46 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.4 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.11 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.86 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.25 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.77 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.56 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.61 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.18 
 
 		 330 aa  201  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  36.86 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.29 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  34.9 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.22 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  36.92 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  32.38 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  32.89 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  29.49 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  27.42 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  28.31 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.42 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  25.08 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.39 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  24.57 
 
 		 601 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  28.87 
 
 		 576 aa  87.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  28.87 
 
 		 576 aa  87.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  24.41 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.68 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.43 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  31.55 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.86 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  26.97 
 
 		 691 aa  66.6  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.74 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.94 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1179  hypothetical protein  24.31 
 
 		 557 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0502  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.77 
 
 		 102 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.77 
 
 		 102 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  27.16 
 
 		 755 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>