70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03116 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  100 
 
 
713 aa  1455    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  34.17 
 
 
570 aa  257  4e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  29.78 
 
 
576 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  29.78 
 
 
576 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  29.65 
 
 
601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  40.14 
 
 
691 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.52 
 
 
317 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.14 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.55 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.55 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.54 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.924157 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30 
 
 
306 aa  76.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.14 
 
 
321 aa  77  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.72 
 
 
313 aa  76.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.32 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.77 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
339 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
339 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.94 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  34.55 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.24 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  32.76 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.16 
 
 
330 aa  67.4  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
337 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
334 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  35.15 
 
 
337 aa  64.7  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  34.55 
 
 
340 aa  63.9  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  26.54 
 
 
336 aa  63.9  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  33.91 
 
 
334 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.52 
 
 
323 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.95 
 
 
306 aa  63.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.43 
 
 
302 aa  61.6  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29.88 
 
 
331 aa  61.2  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.49 
 
 
324 aa  60.8  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.95 
 
 
318 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.91 
 
 
326 aa  58.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.82 
 
 
326 aa  58.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.82 
 
 
329 aa  57.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.49 
 
 
327 aa  57.4  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.31 
 
 
323 aa  57.4  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  31.48 
 
 
305 aa  57  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  33.33 
 
 
337 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.52 
 
 
324 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.31 
 
 
329 aa  56.6  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.06 
 
 
323 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  33.33 
 
 
337 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  32.04 
 
 
337 aa  55.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.06 
 
 
317 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.75 
 
 
301 aa  55.1  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  34.82 
 
 
333 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.3 
 
 
334 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  33.33 
 
 
333 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.33 
 
 
349 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  33.93 
 
 
333 aa  53.1  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.92 
 
 
290 aa  52  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  30.72 
 
 
333 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.75 
 
 
315 aa  52  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  32.14 
 
 
331 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.92 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.61 
 
 
308 aa  48.9  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.22 
 
 
330 aa  47.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25 
 
 
309 aa  47.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  29.01 
 
 
299 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25 
 
 
307 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.97 
 
 
328 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  23.3 
 
 
351 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.381689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>