91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1495 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  100 
 
 		 317 aa  647    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  84.81 
 
 		 317 aa  533  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.13 
 
 		 320 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  80.82 
 
 		 320 aa  513  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  85.32 
 
 		 321 aa  504  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  78.25 
 
 		 333 aa  502  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  77.43 
 
 		 319 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  77.43 
 
 		 321 aa  488  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  68.04 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  68.04 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  62.5 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  63.67 
 
 		 326 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  62.42 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  62.06 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  61.61 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.14 
 
 		 322 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  61.74 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  64.19 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.02 
 
 		 324 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  65.08 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.14 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.14 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  62.21 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  61.56 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  62.54 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  60.91 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  61.82 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  61.82 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  61.82 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  61.82 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  61.82 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  61.82 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  61.49 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  59.69 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  63.23 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.06 
 
 		 323 aa  362  4e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.67 
 
 		 324 aa  362  4e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  63.45 
 
 		 323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.59 
 
 		 329 aa  361  8e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  55.12 
 
 		 312 aa  345  7e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  53.23 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  62.63 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  49.83 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  48.29 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  46.96 
 
 		 305 aa  265  8.999999999999999e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  46.15 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  41.28 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.66 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  42.28 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  41.95 
 
 		 333 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  42.62 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  42.62 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.78 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.89 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.05 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.51 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.28 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  43.69 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.01 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.31 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.35 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.31 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.06 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  37.37 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  36.09 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  34.35 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.56 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.81 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.22 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  33.22 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  28.53 
 
 		 351 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  28.25 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  29.32 
 
 		 390 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  27.18 
 
 		 447 aa  99.4  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  30.93 
 
 		 576 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  30.93 
 
 		 576 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.15 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  26.03 
 
 		 601 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  25.95 
 
 		 570 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.12 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  32.54 
 
 		 713 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.05 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.64 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  21.19 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.03 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  25.14 
 
 		 691 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0502  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.9 
 
 		 102 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1179  hypothetical protein  25.97 
 
 		 557 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.71 
 
 		 102 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0402  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.87 
 
 		 102 aa  42.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>