91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1394 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  100 
 
 		 337 aa  686    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  93.47 
 
 		 337 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  84.32 
 
 		 337 aa  564  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  84.27 
 
 		 334 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  83.98 
 
 		 334 aa  557  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  83.58 
 
 		 337 aa  557  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  87.5 
 
 		 340 aa  552  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  86.73 
 
 		 337 aa  537  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  72.57 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  72.57 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  72.57 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  72.57 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  74.15 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  74.15 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  77.41 
 
 		 334 aa  472  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  73.54 
 
 		 339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  69.49 
 
 		 312 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  66.21 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  61.83 
 
 		 320 aa  401  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  65.19 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  61.56 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  60.39 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.14 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60.54 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  58.65 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.67 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  53.53 
 
 		 317 aa  349  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  56.21 
 
 		 322 aa  350  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  55.44 
 
 		 318 aa  342  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  56.48 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.37 
 
 		 330 aa  338  8e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  57.29 
 
 		 329 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  56.75 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.04 
 
 		 323 aa  331  9e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.85 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  56.16 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.58 
 
 		 324 aa  328  7e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.36 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.88 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  50.5 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.79 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  53.63 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  47.94 
 
 		 334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  50.33 
 
 		 305 aa  295  7e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  56.79 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  48.14 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  49.06 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  47.12 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  47.46 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  47.12 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.95 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  43.81 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.82 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.86 
 
 		 315 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.52 
 
 		 306 aa  235  9e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.81 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.66 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.18 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  42.12 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  35.06 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  37.97 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.5 
 
 		 306 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.73 
 
 		 299 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.03 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.02 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.59 
 
 		 303 aa  189  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.89 
 
 		 293 aa  182  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  36.09 
 
 		 294 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  37.76 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.1 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  31.55 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  30.45 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.72 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  28.85 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.77 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  29.84 
 
 		 390 aa  112  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.41 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  33.12 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.7 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.53 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  27.15 
 
 		 601 aa  86.3  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  27.15 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  27.15 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  27.42 
 
 		 570 aa  79.3  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  33.33 
 
 		 713 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  29.12 
 
 		 691 aa  67  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.03 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2242  Transcription factor TFIIB cyclin-related  33.78 
 
 		 103 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2265  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  60.71 
 
 		 195 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.902084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.9 
 
 		 102 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0402  Transcription factor TFIIB cyclin-related  33.33 
 
 		 102 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>