91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2805 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  100 
 
 		 326 aa  664    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  94.53 
 
 		 329 aa  594  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  83.49 
 
 		 323 aa  528  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  81.33 
 
 		 322 aa  525  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  89.56 
 
 		 327 aa  526  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  85.44 
 
 		 324 aa  523  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  85.03 
 
 		 326 aa  501  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  77.02 
 
 		 323 aa  477  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  84.48 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.51 
 
 		 323 aa  471  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  80.82 
 
 		 329 aa  471  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  75.48 
 
 		 330 aa  464  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  77.93 
 
 		 324 aa  454  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  78.5 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.31 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  63.06 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.67 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  63.06 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.36 
 
 		 317 aa  391  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.83 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.21 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  59.49 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  65.09 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  55.73 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  55.31 
 
 		 337 aa  349  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  55.92 
 
 		 340 aa  348  8e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  55.34 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  55.88 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  56.55 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  56.48 
 
 		 337 aa  332  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  55.86 
 
 		 318 aa  332  5e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  56.81 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  54.92 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  54.92 
 
 		 339 aa  329  3e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  53.09 
 
 		 334 aa  329  4e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  54.58 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  54.58 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  54.58 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  54.58 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  55.74 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  54.24 
 
 		 339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  53.63 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  47.59 
 
 		 313 aa  289  6e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  45.27 
 
 		 306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  45.89 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  43.99 
 
 		 331 aa  242  5e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  42.01 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  44.6 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  43.45 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.86 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.88 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.75 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  40.21 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  44.82 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  39.67 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  42.48 
 
 		 331 aa  229  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.07 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.01 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.77 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.19 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.4 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.47 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.91 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  39.85 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.77 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.19 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.66 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  35.22 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  32.54 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  31.54 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  29.1 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  28.3 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  28.34 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.68 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  26.17 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.4 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  26.03 
 
 		 601 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  25.93 
 
 		 570 aa  80.1  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  24.83 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  24.83 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.73 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.28 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.89 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  29.17 
 
 		 713 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.18 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.42 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0402  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.54 
 
 		 102 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463752  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  22.34 
 
 		 691 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0502  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.75 
 
 		 102 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  27.27 
 
 		 755 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.55 
 
 		 102 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>