83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1743 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  77.18 
 
 		 298 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  73.49 
 
 		 298 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  70.81 
 
 		 298 aa  437  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  33.22 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  31.79 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  31.35 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  31.79 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  31.79 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  31.79 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  31.35 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  31.8 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  31.8 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  31.8 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  30.94 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  29.84 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  30.82 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  29.97 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  29.64 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  30.29 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  27.45 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  30.97 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.16 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.1 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  29.64 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.69 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  32.39 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  30.87 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.43 
 
 		 322 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  30.03 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  30.77 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  29.11 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  30.98 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.27 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.45 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.84 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29.87 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.87 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  28.62 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.43 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.23 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.88 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.9 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.86 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  30.89 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.81 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.96 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.15 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.74 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.81 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.07 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.71 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.05 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.52 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.53 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.75 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.34 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  23.68 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.72 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.07 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.92 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.46 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.86 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.37 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.73 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.34 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.21 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.81 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.94 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.48 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.07 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.37 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.41 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  22.52 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  21.35 
 
 		 691 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  23.55 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  21.8 
 
 		 233 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.74 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.4 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  36.84 
 
 		 755 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  20.81 
 
 		 576 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  20.81 
 
 		 576 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1257  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.41 
 
 		 170 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>