16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1257 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1257  Zinc finger TFIIB-type domain protein  100 
 
 		 170 aa  336  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2265  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.9 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.902084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  50 
 
 		 313 aa  50.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  48.28 
 
 		 327 aa  45.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.11 
 
 		 312 aa  44.3  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.41 
 
 		 298 aa  44.3  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  48.28 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  46.67 
 
 		 337 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.6 
 
 		 298 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  39.39 
 
 		 337 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  44.83 
 
 		 286 aa  42  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.33 
 
 		 306 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0430  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  42.42 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  36.36 
 
 		 340 aa  41.2  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25 
 
 		 298 aa  40.8  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  48.28 
 
 		 298 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>