13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0430 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0430  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  352  1e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0955  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.05 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2132  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.25 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1330  transcription factor TFIIB cyclin-related  32 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.301409  normal  0.138516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1649  transcription factor TFIIB, cyclin-related  31.61 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.821335 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1055  transcription factor TFIIB, cyclin-related  30.86 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0859371 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  24.68 
 
 		 336 aa  42.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.56 
 
 		 323 aa  42  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1257  Zinc finger TFIIB-type domain protein  42.42 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1092  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.51 
 
 		 322 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0050  hypothetical protein  45 
 
 		 109 aa  40.8  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.89 
 
 		 323 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>