18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0955 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0955  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1330  transcription factor TFIIB cyclin-related  60.39 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.301409  normal  0.138516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2132  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  55.19 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1055  transcription factor TFIIB, cyclin-related  52.98 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0859371 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1649  transcription factor TFIIB, cyclin-related  43.62 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.821335 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0430  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.05 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  30.14 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.23 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  22.79 
 
 		 339 aa  44.3  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  22.79 
 
 		 339 aa  44.3  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  22.79 
 
 		 339 aa  44.3  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  22.79 
 
 		 339 aa  44.3  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.2 
 
 		 334 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  22.79 
 
 		 339 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  22.79 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  22.96 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.33 
 
 		 330 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  22.22 
 
 		 339 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>