35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50377 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  100 
 
 		 755 aa  1555    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  35.23 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  35.14 
 
 		 333 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  35.14 
 
 		 331 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  31.82 
 
 		 333 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  38.57 
 
 		 298 aa  50.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  23.87 
 
 		 327 aa  49.7  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  29.11 
 
 		 312 aa  50.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  26.29 
 
 		 447 aa  48.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.19 
 
 		 315 aa  48.1  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  35.19 
 
 		 313 aa  47.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.89 
 
 		 301 aa  47.8  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  30.14 
 
 		 339 aa  47  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  30.14 
 
 		 339 aa  47  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  30.14 
 
 		 339 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  30.14 
 
 		 339 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  30.14 
 
 		 339 aa  47  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  30.14 
 
 		 339 aa  47  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  37.5 
 
 		 298 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.41 
 
 		 320 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  38.6 
 
 		 336 aa  45.8  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.41 
 
 		 320 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.43 
 
 		 324 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  33.33 
 
 		 390 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.77 
 
 		 326 aa  45.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  29.11 
 
 		 329 aa  45.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  28.77 
 
 		 339 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.77 
 
 		 329 aa  44.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.05 
 
 		 306 aa  44.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  24 
 
 		 350 aa  44.3  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  30.14 
 
 		 334 aa  44.3  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.38 
 
 		 322 aa  43.9  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.05 
 
 		 330 aa  43.9  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>