83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0013 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  100 
 
 		 306 aa  628  1e-179  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.49 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.69 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.04 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.14 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.47 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  36.86 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  39.64 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  39.29 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  38.93 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  37.93 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  38.83 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  37.38 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  37.38 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  37.38 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  37.38 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  37.38 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  37.38 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.1 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  38.57 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  37.8 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  37.06 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  37.15 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.69 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  36.88 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.59 
 
 		 323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.5 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.29 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.29 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.48 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  36.63 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.23 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.5 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  37.1 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  33.57 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.77 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.77 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  37.5 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  37.11 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.67 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.07 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  33.56 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  37.14 
 
 		 337 aa  168  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  36.14 
 
 		 333 aa  168  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  35.09 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  35.79 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.31 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  33.68 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  36 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.36 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  33.33 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.56 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.83 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  38.69 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.71 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.71 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  31.13 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  31.47 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  32.74 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.41 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.94 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  26.89 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29.69 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.76 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.72 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.69 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  27.59 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  26 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.18 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  26.54 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.57 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  24.68 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  25.09 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  26.58 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  22.64 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  20.91 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.53 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  23.19 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  24.19 
 
 		 601 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  22.05 
 
 		 570 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  22.42 
 
 		 576 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  22.42 
 
 		 576 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  22.14 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>