86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1047 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  100 
 
 		 286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  61.21 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  59.32 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  60.99 
 
 		 290 aa  316  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  55.44 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  50.88 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  47.89 
 
 		 308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  50.87 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  46.93 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.26 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.16 
 
 		 326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.31 
 
 		 317 aa  211  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.21 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.61 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.01 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.01 
 
 		 324 aa  208  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.46 
 
 		 321 aa  208  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.12 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.31 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.01 
 
 		 324 aa  206  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.81 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.77 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.16 
 
 		 319 aa  204  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.91 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.77 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.77 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.34 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.26 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.56 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  40.27 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  40.27 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  40.41 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  40.55 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  40.42 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.22 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.97 
 
 		 312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  39.1 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  39.1 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  39.1 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  39.1 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  38.75 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  38.75 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  38.75 
 
 		 339 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.51 
 
 		 334 aa  185  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  38.41 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.45 
 
 		 317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.03 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  39.37 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  35.64 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.36 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  39.02 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  39.37 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  40.97 
 
 		 333 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.72 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.09 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.67 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.11 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  36.24 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  31.93 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  36.33 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  35.99 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  35.29 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  34.95 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  35.42 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.18 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.72 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.9 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  29.1 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  25.24 
 
 		 351 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.18 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.17 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  23.86 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  26.49 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.58 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  27.06 
 
 		 601 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  26.98 
 
 		 570 aa  67  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  24.67 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  20.76 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  24.56 
 
 		 691 aa  63.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.09 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.46 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.34 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  25.43 
 
 		 576 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  25.43 
 
 		 576 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.33 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.58 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>