74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36784 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  100 
 
 
576 aa  1197    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  100 
 
 
576 aa  1197    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  35.54 
 
 
601 aa  246  9e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  37.28 
 
 
570 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  29.55 
 
 
713 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  32.87 
 
 
691 aa  146  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.9 
 
 
317 aa  84  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  30.93 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.87 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  27.3 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.87 
 
 
320 aa  77  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.87 
 
 
320 aa  77  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  30.77 
 
 
334 aa  77  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.5 
 
 
322 aa  77  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.33 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  25.67 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  25.67 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  26 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  26 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  26 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  26 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.4 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.35 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  22.87 
 
 
336 aa  73.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  26.67 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.99 
 
 
302 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.67 
 
 
331 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  26.67 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  25.33 
 
 
339 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.16 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  27.14 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  27.67 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.5 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  25.17 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  25.16 
 
 
333 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.35 
 
 
319 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.16 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  25.67 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.51 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.83 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.49 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.15 
 
 
306 aa  67  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.83 
 
 
329 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  27.15 
 
 
337 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.83 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  24.5 
 
 
333 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.83 
 
 
329 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.32 
 
 
315 aa  64.3  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  26.82 
 
 
337 aa  63.9  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.83 
 
 
324 aa  63.5  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  27.15 
 
 
337 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.92 
 
 
349 aa  63.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.75 
 
 
307 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.78 
 
 
309 aa  61.6  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  23.83 
 
 
331 aa  60.8  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  32.68 
 
 
328 aa  60.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.82 
 
 
301 aa  60.5  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  26.11 
 
 
233 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.67 
 
 
309 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.33 
 
 
327 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  23.05 
 
 
308 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.03 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  20.63 
 
 
306 aa  55.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  22.61 
 
 
390 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.17 
 
 
333 aa  55.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.03 
 
 
317 aa  53.5  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.43 
 
 
286 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.93 
 
 
299 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  22.89 
 
 
351 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.42 
 
 
306 aa  51.2  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.28 
 
 
330 aa  48.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  25.41 
 
 
327 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  21.08 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  21.45 
 
 
298 aa  44.3  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>