91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0963 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  100 
 
 
337 aa  682    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  93.47 
 
 
337 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  84.52 
 
 
337 aa  556  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  84.87 
 
 
334 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  83.38 
 
 
337 aa  554  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  84.27 
 
 
334 aa  549  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  86.77 
 
 
337 aa  541  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  86.86 
 
 
340 aa  543  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  70.88 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  70.88 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  70.88 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  70.88 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  70.88 
 
 
339 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  77.1 
 
 
334 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  77.78 
 
 
339 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  77.78 
 
 
339 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  66.34 
 
 
312 aa  419  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  66.22 
 
 
321 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  61.64 
 
 
320 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  61.64 
 
 
320 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  60.91 
 
 
317 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  60.13 
 
 
313 aa  383  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.8 
 
 
317 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  59.21 
 
 
319 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  57.99 
 
 
321 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  58.62 
 
 
333 aa  368  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  56.06 
 
 
322 aa  344  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  56.81 
 
 
326 aa  338  7e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  55.14 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  56.95 
 
 
329 aa  335  7e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.45 
 
 
318 aa  333  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.37 
 
 
330 aa  332  4e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  56.51 
 
 
326 aa  331  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  55.89 
 
 
323 aa  331  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.06 
 
 
323 aa  329  4e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  56.75 
 
 
327 aa  328  7e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  53.12 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  55.44 
 
 
324 aa  325  8.000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  51.16 
 
 
306 aa  322  7e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.95 
 
 
329 aa  318  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.79 
 
 
323 aa  317  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.67 
 
 
349 aa  315  5e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  48.39 
 
 
334 aa  305  6e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  50.85 
 
 
305 aa  291  8e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  47.67 
 
 
333 aa  282  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  56.45 
 
 
333 aa  281  9e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  46.67 
 
 
331 aa  280  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  47.33 
 
 
333 aa  279  4e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  49.69 
 
 
327 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  46.33 
 
 
333 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  44.41 
 
 
336 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.81 
 
 
302 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.98 
 
 
301 aa  263  3e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.36 
 
 
315 aa  249  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.24 
 
 
306 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.16 
 
 
307 aa  226  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.81 
 
 
330 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.18 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  40.62 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  35.08 
 
 
318 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  38.11 
 
 
309 aa  202  7e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.24 
 
 
290 aa  202  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.37 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.53 
 
 
299 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.14 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.89 
 
 
303 aa  189  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  37.42 
 
 
328 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.1 
 
 
309 aa  179  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  32.67 
 
 
293 aa  178  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  35.86 
 
 
294 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  31.47 
 
 
351 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  30.06 
 
 
350 aa  142  6e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.63 
 
 
286 aa  123  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  28.16 
 
 
447 aa  116  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  29.75 
 
 
390 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.84 
 
 
298 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.31 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  32.57 
 
 
298 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  27.24 
 
 
601 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.18 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  27.15 
 
 
576 aa  86.3  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  27.15 
 
 
576 aa  86.3  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  25.58 
 
 
570 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.62 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  33.33 
 
 
713 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  29.12 
 
 
691 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.77 
 
 
233 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2242  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.14 
 
 
103 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0402  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.67 
 
 
102 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.9 
 
 
102 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1179  hypothetical protein  25.97 
 
 
557 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>