87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4179 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  100 
 
 
321 aa  658    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.56 
 
 
320 aa  517  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.25 
 
 
320 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  84.39 
 
 
321 aa  508  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  80.06 
 
 
317 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  76.49 
 
 
319 aa  491  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  77.43 
 
 
317 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  83.56 
 
 
333 aa  481  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  64.93 
 
 
318 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  65.28 
 
 
317 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.54 
 
 
322 aa  388  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.89 
 
 
326 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  58.31 
 
 
337 aa  373  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.21 
 
 
326 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  61.09 
 
 
340 aa  371  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  60.12 
 
 
324 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  60.75 
 
 
334 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.84 
 
 
329 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  63.54 
 
 
323 aa  368  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  57.76 
 
 
337 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.82 
 
 
324 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  60.07 
 
 
334 aa  364  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  60.75 
 
 
334 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  57.41 
 
 
339 aa  363  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.85 
 
 
329 aa  363  2e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  57.41 
 
 
339 aa  363  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  59.87 
 
 
323 aa  362  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  61.69 
 
 
327 aa  362  4e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  61.99 
 
 
349 aa  362  6e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  57.1 
 
 
339 aa  362  6e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  57.1 
 
 
339 aa  362  6e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  57.1 
 
 
339 aa  362  6e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  57.1 
 
 
339 aa  362  6e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  57.1 
 
 
339 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.5 
 
 
330 aa  359  3e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  61.43 
 
 
337 aa  359  4e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  58.6 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  61.09 
 
 
337 aa  355  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  58.82 
 
 
323 aa  348  7e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  56.29 
 
 
312 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  53.23 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  61.11 
 
 
333 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  49.83 
 
 
313 aa  311  6.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.85 
 
 
306 aa  271  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  45.21 
 
 
305 aa  250  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  39.93 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.16 
 
 
302 aa  242  7e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  40.38 
 
 
331 aa  239  5e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  41.23 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  44.55 
 
 
327 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  40.19 
 
 
333 aa  237  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  40.26 
 
 
333 aa  236  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  39.65 
 
 
308 aa  229  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.96 
 
 
307 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.95 
 
 
301 aa  226  6e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.34 
 
 
309 aa  226  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.58 
 
 
315 aa  225  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.05 
 
 
306 aa  224  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.46 
 
 
286 aa  222  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.54 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  42.31 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  38.81 
 
 
290 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  37.45 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  38.46 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.14 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.83 
 
 
306 aa  172  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  31.99 
 
 
293 aa  172  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  32.74 
 
 
309 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  32.43 
 
 
318 aa  169  8e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  32.21 
 
 
294 aa  155  9e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  29.11 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  27.6 
 
 
350 aa  115  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  28.34 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25 
 
 
286 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  24.34 
 
 
447 aa  92.4  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  26.4 
 
 
576 aa  85.9  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  26.4 
 
 
576 aa  85.9  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  24.07 
 
 
570 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  23.71 
 
 
601 aa  82.8  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.6 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  34.32 
 
 
713 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.65 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.15 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.37 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  25.84 
 
 
691 aa  62.8  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.91 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.42 
 
 
233 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>