78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85155 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  100 
 
 
350 aa  725    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  47.02 
 
 
351 aa  294  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  39.64 
 
 
447 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  29.46 
 
 
390 aa  142  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  30.31 
 
 
340 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  30.23 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  29.75 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  30.23 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  29.03 
 
 
312 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.04 
 
 
306 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  29.58 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  28.75 
 
 
334 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  28.57 
 
 
339 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  28.57 
 
 
339 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  28.57 
 
 
339 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  28.57 
 
 
339 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  28.57 
 
 
339 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  28.57 
 
 
339 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29.18 
 
 
313 aa  122  9e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  30.55 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.53 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  28.27 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  30.06 
 
 
337 aa  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.42 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.42 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.42 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.25 
 
 
317 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.8 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.97 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  29.22 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  26.69 
 
 
336 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  28.66 
 
 
337 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.57 
 
 
330 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.02 
 
 
334 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.3 
 
 
324 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.77 
 
 
317 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.25 
 
 
315 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.44 
 
 
324 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.42 
 
 
319 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.72 
 
 
302 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.89 
 
 
301 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.04 
 
 
323 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.3 
 
 
329 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  28.3 
 
 
327 aa  103  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.3 
 
 
326 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.6 
 
 
321 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.1 
 
 
317 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.99 
 
 
333 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.2 
 
 
318 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.67 
 
 
327 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.9 
 
 
307 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26 
 
 
306 aa  99.4  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.65 
 
 
323 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.33 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.01 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.37 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  23.7 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  23.7 
 
 
333 aa  92.8  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  23.7 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  22.98 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.16 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.58 
 
 
306 aa  87.8  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.86 
 
 
290 aa  85.9  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.86 
 
 
286 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  23.93 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.81 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  22.58 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.3 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  19.87 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  23.84 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.11 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  22.07 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  20.2 
 
 
309 aa  62.8  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.05 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  21.86 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.35 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  21.22 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37556  predicted protein  50 
 
 
703 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>