89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2412 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  100 
 
 		 324 aa  663    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  82.13 
 
 		 322 aa  499  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  77.13 
 
 		 330 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  84.72 
 
 		 323 aa  480  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  78.19 
 
 		 326 aa  475  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  84.38 
 
 		 329 aa  477  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  75 
 
 		 323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  76.11 
 
 		 323 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  79.25 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  75 
 
 		 326 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  80.07 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  77.93 
 
 		 329 aa  448  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  71.87 
 
 		 324 aa  441  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  81.69 
 
 		 333 aa  428  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.01 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.9 
 
 		 321 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  61.64 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  64.85 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  61.15 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  61.74 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.01 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60.39 
 
 		 319 aa  368  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  65.83 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  55.56 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  55.37 
 
 		 334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  57.58 
 
 		 318 aa  335  7.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  58.25 
 
 		 317 aa  334  9e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  56.08 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  55.19 
 
 		 334 aa  332  4e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  54.87 
 
 		 337 aa  332  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  53.16 
 
 		 312 aa  325  6e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  53.16 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  53.16 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  53.16 
 
 		 339 aa  315  8e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  53.16 
 
 		 339 aa  315  8e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  53.16 
 
 		 339 aa  315  8e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  53.16 
 
 		 339 aa  315  8e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  50.93 
 
 		 334 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  52.82 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  55.75 
 
 		 337 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  54.36 
 
 		 337 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  53.99 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  47.04 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.59 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  44.41 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.81 
 
 		 302 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  46.82 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  45.52 
 
 		 331 aa  235  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  42.86 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  43.21 
 
 		 333 aa  235  9e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.31 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.47 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.24 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  42.16 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  42.51 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.96 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.06 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.01 
 
 		 286 aa  222  8e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  38.93 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.47 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.84 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.3 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.86 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  39.31 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.1 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  33.89 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.23 
 
 		 303 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.44 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.79 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  34.68 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  29.52 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  28.48 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  27.68 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.44 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.03 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.49 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  23.26 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.87 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  24.91 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  23.47 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.67 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.45 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  29.52 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.48 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  23.16 
 
 		 691 aa  49.3  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.18 
 
 		 102 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0502  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.22 
 
 		 102 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  30.3 
 
 		 755 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37556  predicted protein  31.67 
 
 		 703 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>