80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30925 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  100 
 
 		 601 aa  1244    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  35.39 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  35.39 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  41.04 
 
 		 570 aa  251  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  34.89 
 
 		 691 aa  194  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  30.26 
 
 		 713 aa  189  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.77 
 
 		 315 aa  92.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  29.56 
 
 		 233 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.87 
 
 		 306 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.74 
 
 		 302 aa  88.6  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.68 
 
 		 306 aa  87.8  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  24.83 
 
 		 336 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.34 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.9 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  27.99 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  28.14 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  28.14 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  28.14 
 
 		 339 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.98 
 
 		 326 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  27.59 
 
 		 333 aa  80.1  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  28.14 
 
 		 339 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  28.14 
 
 		 339 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  28.14 
 
 		 339 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  28.14 
 
 		 339 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.68 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.15 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.88 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  27.8 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.57 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.13 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.33 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  27.59 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.08 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.58 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.09 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.53 
 
 		 320 aa  76.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.53 
 
 		 320 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.37 
 
 		 317 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  26.11 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  26.28 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  26.75 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  28.08 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  27.24 
 
 		 331 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.5 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.34 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  26.46 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  26.8 
 
 		 334 aa  72  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.75 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.69 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  26.46 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  28.67 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.49 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.17 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.45 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.17 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.98 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.79 
 
 		 327 aa  67  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  27.74 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.48 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.23 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.91 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.57 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.91 
 
 		 307 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  23.91 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.65 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  26.9 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.51 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.86 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.42 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.54 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  28.02 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.42 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.19 
 
 		 309 aa  57  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.65 
 
 		 309 aa  55.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  23.05 
 
 		 447 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  23.55 
 
 		 298 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  21.68 
 
 		 318 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  22.34 
 
 		 279 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.3 
 
 		 298 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>