82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0979 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.56 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.84 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.43 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.14 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.81 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  38.06 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  37.85 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  37.5 
 
 		 339 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  37.5 
 
 		 339 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  37.5 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  37.5 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  37.5 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  37.5 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  37.5 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.16 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  35.27 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  35.27 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  36.3 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  37.07 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  34.59 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.64 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  34.25 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  34.25 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.26 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.72 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.6 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.66 
 
 		 349 aa  188  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.46 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.82 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  33.56 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.22 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.22 
 
 		 320 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  37.01 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.88 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.91 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.94 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.66 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.82 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.39 
 
 		 334 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.23 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  32.99 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.66 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.66 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.67 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  32.64 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.83 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  34.01 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.74 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  31.94 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  32.29 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  33.89 
 
 		 337 aa  171  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  34.59 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.85 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.14 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  36.49 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  32.87 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  28.12 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.43 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.45 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.72 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.85 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.87 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  27.05 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.1 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.54 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  25.91 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.01 
 
 		 328 aa  99  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.45 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.35 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.64 
 
 		 279 aa  90.1  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  23.38 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  25.74 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  24.32 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.87 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  20.61 
 
 		 447 aa  69.3  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  23.05 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  22.3 
 
 		 601 aa  65.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  21.79 
 
 		 570 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  22.43 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  24.26 
 
 		 713 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  23.62 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>