82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43151 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  100 
 
 
390 aa  813    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  29.46 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  30.99 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.62 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  32.27 
 
 
447 aa  116  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.77 
 
 
330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.34 
 
 
326 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.662077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.27 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  29.1 
 
 
319 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.09 
 
 
323 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.31 
 
 
320 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.99 
 
 
320 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  26.73 
 
 
336 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.53 
 
 
324 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.85 
 
 
323 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.22 
 
 
329 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.99 
 
 
317 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28.21 
 
 
313 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.05 
 
 
302 aa  103  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.07 
 
 
312 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.34 
 
 
326 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.08 
 
 
327 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.66 
 
 
321 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.34 
 
 
329 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.36 
 
 
349 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.75 
 
 
323 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.14 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.2 
 
 
301 aa  97.8  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  30.39 
 
 
337 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  29.97 
 
 
337 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  30.29 
 
 
334 aa  96.3  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.32 
 
 
317 aa  96.3  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.3 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.34 
 
 
321 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  30.29 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  29.71 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  27.18 
 
 
305 aa  94.4  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.4 
 
 
315 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.33 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.37 
 
 
306 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.32 
 
 
330 aa  89.4  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  26.62 
 
 
333 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  30.87 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  27.69 
 
 
339 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  26.77 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  27.69 
 
 
339 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  27.69 
 
 
339 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  27.69 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  27.69 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  27.69 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  27.69 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.88 
 
 
317 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.03 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  29.75 
 
 
337 aa  84  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  29.84 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  25.58 
 
 
333 aa  82  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.79 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  25.58 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.46 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.58 
 
 
306 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.49 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  25.73 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  27.17 
 
 
308 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  25 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.87 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  24.94 
 
 
601 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.74 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  25.51 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  23.38 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.91 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.12 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  23.66 
 
 
328 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.62 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  24.92 
 
 
294 aa  60.5  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.54 
 
 
298 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  20.26 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  22.61 
 
 
576 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  22.61 
 
 
576 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37556  predicted protein  32.29 
 
 
703 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  21.9 
 
 
570 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  21.74 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  21.19 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>