86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0317 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  100 
 
 		 299 aa  604  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  67.56 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  59.32 
 
 		 286 aa  333  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  58.19 
 
 		 290 aa  305  7e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  57.09 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  48.31 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  49.83 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  47.06 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  46.08 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.52 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.49 
 
 		 323 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.15 
 
 		 349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.44 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.54 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.84 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.49 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.27 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.12 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.78 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.47 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.47 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.78 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.58 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.93 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  40 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.41 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.41 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  41.41 
 
 		 334 aa  202  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  41.08 
 
 		 334 aa  201  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  40.26 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  41.08 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  40.4 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  40.4 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  40.4 
 
 		 339 aa  199  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.13 
 
 		 324 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  40.4 
 
 		 339 aa  199  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  40.4 
 
 		 339 aa  199  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  40.4 
 
 		 339 aa  199  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  38.97 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.53 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  40.07 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.28 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  40.54 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  38.85 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.75 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  38.68 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.85 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  42.76 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  39.73 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.85 
 
 		 317 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  39.53 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.26 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  39.19 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  38.91 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  32.65 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  33.22 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  32.17 
 
 		 336 aa  148  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  32.2 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  37.88 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  35.47 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  35.47 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  34.38 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  34.69 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.61 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.85 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.69 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  26.19 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.9 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.44 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  26.94 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  25.99 
 
 		 351 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  26.3 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  22.9 
 
 		 447 aa  72.4  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  25.28 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  26.17 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.57 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  23.37 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.14 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  22.22 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.22 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  25 
 
 		 576 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  25 
 
 		 576 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  24.04 
 
 		 691 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  22.74 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  29.77 
 
 		 713 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.22 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>