72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40669 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  100 
 
 		 570 aa  1181    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  40.65 
 
 		 601 aa  247  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  33.33 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  37.23 
 
 		 691 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  37.28 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  37.28 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  24.48 
 
 		 336 aa  97.1  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.25 
 
 		 306 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.26 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.19 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.26 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.75 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  24.25 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  24.33 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  24.33 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.32 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.73 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  25.08 
 
 		 313 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.37 
 
 		 301 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  27.13 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.07 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.75 
 
 		 321 aa  76.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.41 
 
 		 320 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.41 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  24 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.49 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.91 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  24.23 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  24.23 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  24.23 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  24.23 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  24.23 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  25.85 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.2 
 
 		 307 aa  72  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  24.23 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  25.25 
 
 		 327 aa  72  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  23.89 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.03 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.32 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  26.44 
 
 		 337 aa  70.1  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  25.17 
 
 		 340 aa  70.1  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  25.42 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  25.51 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.95 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.74 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.93 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.93 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.87 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.47 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  27.42 
 
 		 334 aa  67  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.49 
 
 		 319 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.98 
 
 		 286 aa  67  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.66 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24.02 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  23.21 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  25.58 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.62 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  20.17 
 
 		 351 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  24.74 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  27.42 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  28 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  24 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.05 
 
 		 306 aa  55.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.33 
 
 		 309 aa  55.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  21.9 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  21.09 
 
 		 279 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.79 
 
 		 303 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  25.6 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  22.5 
 
 		 447 aa  47.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  18.21 
 
 		 286 aa  43.5  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  20.63 
 
 		 294 aa  43.5  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>