54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_94516 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  100 
 
 		 233 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  27.8 
 
 		 601 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  21.7 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.84 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.03 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.94 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.94 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  26.11 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  26.11 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  21.19 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.52 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.48 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.42 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  20.56 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  19.91 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.62 
 
 		 327 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.42 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  20.36 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.87 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  23.03 
 
 		 333 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  20.81 
 
 		 317 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  21.52 
 
 		 331 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.58 
 
 		 323 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  21.92 
 
 		 323 aa  52.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  20.18 
 
 		 302 aa  52  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  21.69 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  23.88 
 
 		 691 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  21.66 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  21.24 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.58 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  21.46 
 
 		 324 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  21.7 
 
 		 298 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  23.18 
 
 		 337 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  23.18 
 
 		 340 aa  49.3  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  25.6 
 
 		 570 aa  48.9  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.12 
 
 		 330 aa  48.9  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  21.1 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  25.53 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  22.58 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  23.31 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  22.13 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  22.73 
 
 		 334 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  20.91 
 
 		 337 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.71 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  21.2 
 
 		 326 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  22.77 
 
 		 337 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  22.27 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  21.28 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  19.82 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  20.85 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  22.03 
 
 		 337 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  25.21 
 
 		 305 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  33.77 
 
 		 713 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>