148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6780 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6780  response regulator receiver protein  100 
 
 		 105 aa  213  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0616  response regulator receiver domain-containing protein  31.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0641  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0650  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0660  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  32.94 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2357  putative PAS/PAC sensor protein  29.7 
 
 		 381 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 573 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3080  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 633 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 571 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  29.89 
 
 		 241 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.52 
 
 		 240 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.24 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 1349 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 572 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0793  response regulator receiver  25.88 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  36.05 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  24.24 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  27.06 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0653  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0268585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2275  DNA-binding transcriptional regulator RstA  35 
 
 		 245 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  30.67 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  24.69 
 
 		 1296 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 433 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 236 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  21.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 503 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  28 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3199  response regulator receiver protein  27.06 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.353432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.24 
 
 		 313 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.49 
 
 		 228 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7525  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.87 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.588744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  25.29 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2580  DNA-binding transcriptional regulator RstA  33.75 
 
 		 245 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.12 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  25.88 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 566 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1739  response regulator receiver domain-containing protein  29.89 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  33.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 394 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 707 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.26 
 
 		 231 aa  42.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  25.88 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  28.24 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  27.63 
 
 		 1378 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27 
 
 		 1956 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  27.38 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  28.24 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  23.47 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  28.09 
 
 		 1313 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 		 222 aa  42  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  27.45 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  31.31 
 
 		 799 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.16 
 
 		 223 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 414 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0609  response regulator receiver domain-containing protein  29.69 
 
 		 191 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0634  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 230 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  32.43 
 
 		 1355 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2112  two component transcriptional regulator  27.06 
 
 		 233 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0703  two component transcriptional regulator  37.65 
 
 		 237 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 233 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 917 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 452 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 237 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.41 
 
 		 223 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0643  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 230 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  26.8 
 
 		 235 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.16 
 
 		 223 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 207 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 279 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  26.8 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  26.8 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  26.47 
 
 		 1989 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 427 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0709  two component transcriptional regulator  37.65 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  28.4 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0723  two component transcriptional regulator  37.65 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  30 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0997  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  33.9 
 
 		 1374 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  28.71 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  26.19 
 
 		 241 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  26.8 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  26.53 
 
 		 1355 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  26.8 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  24.49 
 
 		 260 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 577 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>