More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0997 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0997  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  256  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3199  response regulator receiver protein  88.62 
 
 		 126 aa  224  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.353432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 236 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 224 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 224 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 224 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 224 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 236 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 228 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 263 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 436 aa  87.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.83 
 
 		 244 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 225 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 246 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  41.9 
 
 		 258 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 232 aa  84.3  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 246 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 235 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  38.14 
 
 		 734 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 246 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 271 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  39.34 
 
 		 256 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 230 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 271 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 126 aa  84.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 227 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 227 aa  83.6  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 257 aa  83.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 230 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2404  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6806  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  42.98 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  33.33 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 440 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 433 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.38 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  42.86 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 760 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  42.72 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  41.9 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  41.9 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  41.9 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  41.9 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 452 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  40 
 
 		 268 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 231 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 236 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 236 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 236 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 245 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 340 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  40.2 
 
 		 1020 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  39.6 
 
 		 980 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  38.24 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.74 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  42.98 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.17 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1612  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00249249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.78 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4207  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.771701  normal  0.140814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 896 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>