More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1874 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1874  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254038  normal  0.519638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.91 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.08 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 223 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 223 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  35.81 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  34.38 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  33.92 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  33.93 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  33.92 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.19 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  36.12 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1020  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.43 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  31.47 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.89 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  30.3 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  38.49 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  36.12 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  38.49 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.92 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  38.49 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2556  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000044969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  38.49 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  34.04 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  38.49 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0763  DNA-binding response regulator  31.88 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00370439  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  37.99 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  37.99 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 245 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0978  DNA-binding response regulator  30.13 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  35.15 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1676  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  33.48 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  36.91 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>