241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0774 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  35.09 
 
 		 2110 aa  660    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  35.54 
 
 		 1551 aa  724    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  33.88 
 
 		 1538 aa  738    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  75.52 
 
 		 1366 aa  2092    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  44.93 
 
 		 1318 aa  1172    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  35.49 
 
 		 1727 aa  703    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  37.64 
 
 		 1812 aa  750    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  64.71 
 
 		 1340 aa  1799    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  34.18 
 
 		 1758 aa  670    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  34.83 
 
 		 2168 aa  670    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  100 
 
 		 1323 aa  2734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  33.48 
 
 		 1579 aa  652    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.85 
 
 		 1504 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  31.95 
 
 		 1336 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  32.29 
 
 		 1300 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  31.4 
 
 		 1281 aa  552  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  31.36 
 
 		 1281 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.45 
 
 		 1259 aa  498  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  29.32 
 
 		 1191 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  28.42 
 
 		 1206 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  29.36 
 
 		 1229 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.09 
 
 		 1192 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.31 
 
 		 1152 aa  443  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  30.25 
 
 		 1187 aa  446  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.67 
 
 		 1441 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  28.78 
 
 		 1270 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  30.14 
 
 		 1187 aa  443  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  31.91 
 
 		 1457 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  29.78 
 
 		 1243 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  29.5 
 
 		 1266 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  28.58 
 
 		 1207 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  28.46 
 
 		 1193 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  28.96 
 
 		 1242 aa  430  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  28.63 
 
 		 1190 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  28.31 
 
 		 1205 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  27.89 
 
 		 1213 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  28.9 
 
 		 1196 aa  422  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  27.74 
 
 		 1194 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  28.24 
 
 		 1198 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  28.24 
 
 		 1198 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  28.24 
 
 		 1198 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.45 
 
 		 1253 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  27.78 
 
 		 1203 aa  405  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  29.71 
 
 		 1210 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  29.18 
 
 		 1248 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  28.3 
 
 		 1245 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  37.3 
 
 		 1738 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  28.34 
 
 		 1247 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  28.43 
 
 		 1194 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  28.17 
 
 		 1199 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  26.51 
 
 		 1256 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  28.73 
 
 		 1249 aa  395  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  29.44 
 
 		 1234 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  28.71 
 
 		 1249 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  28.78 
 
 		 1248 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  28.14 
 
 		 1241 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  28.82 
 
 		 1197 aa  386  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.11 
 
 		 1442 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  28.15 
 
 		 1246 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  28.97 
 
 		 1193 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  28.01 
 
 		 1242 aa  380  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  29.48 
 
 		 1173 aa  380  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  28.23 
 
 		 1246 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  28.49 
 
 		 1238 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  29.31 
 
 		 1193 aa  377  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  28.05 
 
 		 1248 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  28.94 
 
 		 1193 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  28.34 
 
 		 1238 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.57 
 
 		 1248 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  28.26 
 
 		 1236 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.35 
 
 		 1220 aa  365  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  26.77 
 
 		 1239 aa  364  6e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  26.97 
 
 		 1244 aa  363  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  28.1 
 
 		 1233 aa  363  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  28.56 
 
 		 1104 aa  363  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  27.02 
 
 		 1250 aa  361  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  28.16 
 
 		 1247 aa  362  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  27.05 
 
 		 1250 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  27.52 
 
 		 1175 aa  352  3e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.15 
 
 		 2065 aa  347  6e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  26.95 
 
 		 1242 aa  345  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  25.9 
 
 		 1250 aa  344  7e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  27.54 
 
 		 1479 aa  343  9e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  36.38 
 
 		 1800 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  27.41 
 
 		 1115 aa  340  8e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.17 
 
 		 2113 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  35.08 
 
 		 1801 aa  338  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.07 
 
 		 1750 aa  331  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  27.74 
 
 		 1056 aa  325  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  26.22 
 
 		 1270 aa  323  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_002950  PG1553  CobN/magnesium chelatase family protein  35.55 
 
 		 1469 aa  317  7e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  28.11 
 
 		 1140 aa  317  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  26.65 
 
 		 1081 aa  315  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  28.44 
 
 		 1109 aa  313  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  26.78 
 
 		 1090 aa  312  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  27.93 
 
 		 1094 aa  311  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0753  Cobaltochelatase  34.41 
 
 		 1413 aa  304  6.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  29.64 
 
 		 1244 aa  304  8.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  31.33 
 
 		 1258 aa  300  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  30.74 
 
 		 1298 aa  296  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>