241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0753 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1553  CobN/magnesium chelatase family protein  39.04 
 
 
1469 aa  1153    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0753  Cobaltochelatase  100 
 
 
1413 aa  2926    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  25.63 
 
 
1277 aa  348  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  23.9 
 
 
1291 aa  346  2e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  25.49 
 
 
1426 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  25.4 
 
 
1293 aa  337  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  25.77 
 
 
1269 aa  333  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  26.4 
 
 
1261 aa  332  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  25.61 
 
 
1330 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  25 
 
 
1267 aa  327  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  38.1 
 
 
1538 aa  326  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.14 
 
 
1442 aa  325  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  26.26 
 
 
1267 aa  323  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  24.43 
 
 
1296 aa  323  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  34.69 
 
 
1340 aa  322  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  34.63 
 
 
1579 aa  321  7e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  24.47 
 
 
1253 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  25.81 
 
 
1263 aa  312  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  33.86 
 
 
1551 aa  303  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  30.96 
 
 
1366 aa  300  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  34.7 
 
 
1323 aa  298  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  32.35 
 
 
1812 aa  296  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  26.02 
 
 
1364 aa  295  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  25 
 
 
1286 aa  295  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  34.29 
 
 
1738 aa  291  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.85 
 
 
1504 aa  285  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.67 
 
 
2065 aa  282  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  31.24 
 
 
1758 aa  278  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  31.39 
 
 
2168 aa  278  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  32.73 
 
 
1727 aa  277  9e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  31 
 
 
1318 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.79 
 
 
2113 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  32.56 
 
 
2110 aa  272  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  32.4 
 
 
1800 aa  266  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  32.18 
 
 
1801 aa  265  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.84 
 
 
1750 aa  255  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  31.3 
 
 
1336 aa  254  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  31.22 
 
 
1281 aa  251  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  30.75 
 
 
1281 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  32.94 
 
 
1300 aa  245  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  32.55 
 
 
1244 aa  243  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  31.93 
 
 
1290 aa  236  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  31.49 
 
 
1277 aa  233  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  32.55 
 
 
1273 aa  231  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  30.84 
 
 
1220 aa  231  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  30.61 
 
 
1220 aa  229  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  31.41 
 
 
1288 aa  229  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 
1281 aa  229  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  28.92 
 
 
1457 aa  229  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 
1220 aa  229  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 
1220 aa  229  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 
1281 aa  229  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  31.07 
 
 
1278 aa  229  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.79 
 
 
1441 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 
1281 aa  228  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  31.14 
 
 
1297 aa  225  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  32.24 
 
 
1242 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  31.65 
 
 
1247 aa  224  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  29.95 
 
 
1269 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  30.48 
 
 
1220 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  29.75 
 
 
1280 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  29.73 
 
 
1269 aa  223  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  31.05 
 
 
1267 aa  223  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  33.18 
 
 
1209 aa  221  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  29.28 
 
 
1269 aa  221  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  30 
 
 
1277 aa  221  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  32.57 
 
 
1261 aa  221  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  30.12 
 
 
1270 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  30.92 
 
 
1263 aa  219  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  30.92 
 
 
1263 aa  218  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  31.19 
 
 
1247 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  29.88 
 
 
1269 aa  218  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  29.88 
 
 
1269 aa  218  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  29.88 
 
 
1270 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  28.87 
 
 
1283 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  31.84 
 
 
1212 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  32.55 
 
 
1453 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  32.32 
 
 
1409 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  29.98 
 
 
1253 aa  216  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  30.5 
 
 
1302 aa  216  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  31.59 
 
 
1435 aa  216  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  31.74 
 
 
1191 aa  216  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  31.4 
 
 
1263 aa  215  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  29.14 
 
 
1300 aa  214  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  30.63 
 
 
1244 aa  214  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  30.68 
 
 
1363 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  29.91 
 
 
1266 aa  212  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  31.16 
 
 
1388 aa  213  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  29.19 
 
 
1270 aa  212  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  32.94 
 
 
1222 aa  211  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0792  Cobaltochelatase  27.83 
 
 
1515 aa  211  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  29.53 
 
 
1276 aa  211  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  30.8 
 
 
1248 aa  211  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  30.11 
 
 
1187 aa  211  8e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  30.84 
 
 
1260 aa  210  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  29.95 
 
 
1249 aa  209  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.6 
 
 
1187 aa  209  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  30.34 
 
 
1257 aa  208  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  30.07 
 
 
1256 aa  208  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  27.65 
 
 
1245 aa  208  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>