241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1542 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  60.45 
 
 		 1261 aa  1512    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  50.23 
 
 		 1277 aa  1321    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  50.5 
 
 		 1277 aa  1327    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  44.61 
 
 		 1234 aa  971    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  38.09 
 
 		 1337 aa  919    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  36.41 
 
 		 1250 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  40 
 
 		 1330 aa  956    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  40.06 
 
 		 1328 aa  969    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  35.77 
 
 		 1269 aa  708    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  34.93 
 
 		 1280 aa  707    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  38.13 
 
 		 1339 aa  924    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  51.76 
 
 		 1296 aa  1294    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  35.65 
 
 		 1267 aa  726    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  34.12 
 
 		 1275 aa  696    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  38.52 
 
 		 1336 aa  904    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  36.2 
 
 		 1266 aa  701    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  35.54 
 
 		 1274 aa  704    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  39.39 
 
 		 1341 aa  936    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 		 1283 aa  2613    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  37.04 
 
 		 1336 aa  902    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  39.31 
 
 		 1328 aa  924    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  42.44 
 
 		 1242 aa  939    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  49.07 
 
 		 1277 aa  1275    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  35.61 
 
 		 1273 aa  717    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  35.09 
 
 		 1267 aa  708    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  39.64 
 
 		 1329 aa  945    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  34.94 
 
 		 1267 aa  709    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  41.54 
 
 		 1249 aa  890    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  39.45 
 
 		 1336 aa  916    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  86.65 
 
 		 1300 aa  2275    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  40.47 
 
 		 1330 aa  976    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  37.77 
 
 		 1269 aa  723    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  39.56 
 
 		 1329 aa  961    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  38.12 
 
 		 1343 aa  889    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  35.13 
 
 		 1268 aa  711    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.08 
 
 		 1217 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.8 
 
 		 1267 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  51.42 
 
 		 1280 aa  1338    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  36.83 
 
 		 1336 aa  913    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  57.94 
 
 		 1245 aa  1442    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  43.73 
 
 		 1241 aa  919    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  40.58 
 
 		 1249 aa  912    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  36.83 
 
 		 1336 aa  913    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  36.76 
 
 		 1335 aa  912    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  38.09 
 
 		 1337 aa  915    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  38.41 
 
 		 1347 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  40 
 
 		 1330 aa  956    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  39.11 
 
 		 1333 aa  951    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  34.12 
 
 		 1273 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  40.14 
 
 		 1248 aa  872    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  51.62 
 
 		 1276 aa  1333    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  32.82 
 
 		 1246 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  32.82 
 
 		 1246 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.64 
 
 		 1248 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  33.25 
 
 		 1233 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.54 
 
 		 1220 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  31.92 
 
 		 1479 aa  595  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  36.07 
 
 		 1187 aa  568  1e-160  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  35.93 
 
 		 1187 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  31.55 
 
 		 1270 aa  543  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  41.04 
 
 		 1248 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  40.03 
 
 		 1247 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  41.04 
 
 		 1248 aa  539  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  31.62 
 
 		 1236 aa  536  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  32.59 
 
 		 1242 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  41.95 
 
 		 1197 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  34.7 
 
 		 1237 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  31.18 
 
 		 1243 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  30.15 
 
 		 1244 aa  513  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  29.34 
 
 		 1343 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  31.79 
 
 		 1266 aa  510  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  31.19 
 
 		 1426 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.31 
 
 		 1285 aa  503  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  33.63 
 
 		 1238 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  34.52 
 
 		 1210 aa  496  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  32.27 
 
 		 1293 aa  495  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  32.4 
 
 		 1264 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  31.12 
 
 		 1270 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  34.56 
 
 		 1207 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  35.2 
 
 		 1222 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  33.96 
 
 		 1222 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  30.55 
 
 		 1263 aa  490  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.98 
 
 		 1192 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  41.76 
 
 		 1244 aa  489  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  41.69 
 
 		 1238 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  39.63 
 
 		 1194 aa  485  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  31.52 
 
 		 1288 aa  485  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.08 
 
 		 1255 aa  486  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  33.22 
 
 		 1193 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  32.03 
 
 		 1209 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  32.48 
 
 		 1199 aa  482  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  38.77 
 
 		 1173 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  41.18 
 
 		 1238 aa  483  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  27.44 
 
 		 1220 aa  481  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.72 
 
 		 1259 aa  483  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  33.91 
 
 		 1207 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.2 
 
 		 1258 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  33.61 
 
 		 1406 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  33.69 
 
 		 1212 aa  479  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  32.15 
 
 		 1206 aa  479  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>