241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0227 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  34.03 
 
 
1277 aa  671    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  33.9 
 
 
1330 aa  734    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  34.09 
 
 
1276 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  33.04 
 
 
1277 aa  651    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  33.44 
 
 
1337 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  79.7 
 
 
1269 aa  2109    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  36.2 
 
 
1283 aa  701    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  34.51 
 
 
1245 aa  664    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  39.41 
 
 
1220 aa  948    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  34 
 
 
1328 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  89.5 
 
 
1267 aa  2405    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  33.08 
 
 
1336 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  34.82 
 
 
1296 aa  675    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  85.64 
 
 
1267 aa  2302    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  62.64 
 
 
1275 aa  1705    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  33.83 
 
 
1336 aa  702    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  38.94 
 
 
1246 aa  947    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  100 
 
 
1266 aa  2637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  60.79 
 
 
1274 aa  1644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  32.94 
 
 
1339 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  33.7 
 
 
1341 aa  723    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  32.95 
 
 
1336 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  33.77 
 
 
1328 aa  707    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  33.64 
 
 
1242 aa  663    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  33.65 
 
 
1277 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  39.36 
 
 
1236 aa  944    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  34.39 
 
 
1248 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  43.82 
 
 
1251 aa  1057    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  31.98 
 
 
1343 aa  674    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  33.71 
 
 
1247 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  38.53 
 
 
1242 aa  915    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  33.03 
 
 
1336 aa  705    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  43.36 
 
 
1250 aa  1062    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  34.01 
 
 
1248 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  34.89 
 
 
1330 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  34.27 
 
 
1261 aa  700    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  38.77 
 
 
1248 aa  934    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  32.82 
 
 
1329 aa  703    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  62.38 
 
 
1280 aa  1701    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  34.29 
 
 
1479 aa  827    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  33.48 
 
 
1333 aa  722    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  36.73 
 
 
1300 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  63.44 
 
 
1273 aa  1723    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  39.29 
 
 
1233 aa  938    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  63.37 
 
 
1217 aa  1623    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  89.82 
 
 
1267 aa  2399    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  34.46 
 
 
1280 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  64 
 
 
1273 aa  1726    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  33.75 
 
 
1329 aa  703    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  80.84 
 
 
1268 aa  2172    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  33.08 
 
 
1336 aa  714    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  32.66 
 
 
1335 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  33.44 
 
 
1337 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  32.74 
 
 
1347 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  86.5 
 
 
1267 aa  2318    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  47.27 
 
 
1269 aa  1234    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  33.9 
 
 
1330 aa  734    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  38.86 
 
 
1246 aa  944    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  32.33 
 
 
1249 aa  633  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  31.8 
 
 
1238 aa  622  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  32.75 
 
 
1234 aa  619  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  32.95 
 
 
1241 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  31.61 
 
 
1244 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  30.83 
 
 
1237 aa  536  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.41 
 
 
1266 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.1 
 
 
1187 aa  532  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.38 
 
 
1187 aa  532  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  32.22 
 
 
1293 aa  529  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.13 
 
 
1285 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  30.41 
 
 
1298 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  28.04 
 
 
1343 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  30.28 
 
 
1426 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  30.88 
 
 
1207 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  29.85 
 
 
1220 aa  501  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  29.74 
 
 
1222 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  29.82 
 
 
1444 aa  490  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  28.66 
 
 
1242 aa  493  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  29.65 
 
 
1222 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  29.31 
 
 
1258 aa  487  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.39 
 
 
1243 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  30.63 
 
 
1191 aa  486  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.96 
 
 
1259 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  34.15 
 
 
1270 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  30.21 
 
 
1206 aa  481  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  29.25 
 
 
1209 aa  479  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  28.16 
 
 
1302 aa  479  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  29.46 
 
 
1207 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  28.04 
 
 
1270 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.13 
 
 
1263 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  28.45 
 
 
1255 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  29.05 
 
 
1256 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  28.5 
 
 
1238 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  28.08 
 
 
1194 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  27.61 
 
 
1266 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  28.76 
 
 
1193 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  28.85 
 
 
1253 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  29.4 
 
 
1291 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  27.72 
 
 
1254 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  28.84 
 
 
1257 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  28.54 
 
 
1435 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>